253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0040 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  460  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  54.3 
 
 
221 aa  246  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  52.7 
 
 
224 aa  238  5.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  49.11 
 
 
238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  48.2 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  52.51 
 
 
221 aa  227  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  52.7 
 
 
222 aa  226  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  51.38 
 
 
222 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  47.98 
 
 
235 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  47.48 
 
 
233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  50.22 
 
 
222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  50 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  47.79 
 
 
226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  47.22 
 
 
222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  44.89 
 
 
234 aa  207  8e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  47.53 
 
 
226 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  46.05 
 
 
244 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  46.88 
 
 
227 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  45.5 
 
 
224 aa  198  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  46.15 
 
 
232 aa  197  7.999999999999999e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  48.65 
 
 
222 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  49.11 
 
 
248 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  47.14 
 
 
243 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  44.39 
 
 
259 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  45.66 
 
 
243 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  46.7 
 
 
252 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  45.7 
 
 
257 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  45.83 
 
 
250 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  38.64 
 
 
232 aa  185  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  41.41 
 
 
290 aa  185  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  42.86 
 
 
219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  42.08 
 
 
259 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  42.73 
 
 
243 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  42.48 
 
 
236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  42.21 
 
 
261 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  42.29 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  42.01 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  47.77 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  45.25 
 
 
257 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  40.89 
 
 
224 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  39.46 
 
 
222 aa  174  8e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  41.56 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  42.73 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  43.67 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  40.97 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  41.07 
 
 
241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  39.46 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  39.46 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  40.81 
 
 
254 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  41.15 
 
 
252 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  43.84 
 
 
224 aa  171  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  41.95 
 
 
234 aa  171  9e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  40.76 
 
 
233 aa  170  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  47.3 
 
 
226 aa  170  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  42.5 
 
 
252 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  41.8 
 
 
253 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  39.91 
 
 
252 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  45.3 
 
 
255 aa  164  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  38.96 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  39.27 
 
 
268 aa  162  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  40.64 
 
 
253 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  39.02 
 
 
262 aa  162  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  40.95 
 
 
254 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  43.1 
 
 
234 aa  161  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  40.17 
 
 
251 aa  161  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  40.52 
 
 
254 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  38.72 
 
 
262 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  42.17 
 
 
239 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  40.24 
 
 
253 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  38.68 
 
 
237 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  42.61 
 
 
231 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  39.3 
 
 
225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  39.75 
 
 
252 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  38.99 
 
 
220 aa  154  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  38.85 
 
 
338 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  36.82 
 
 
268 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  35.98 
 
 
240 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  38.1 
 
 
231 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  43.61 
 
 
226 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  39.22 
 
 
252 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  42.19 
 
 
248 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  38.19 
 
 
261 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  37.78 
 
 
240 aa  148  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  36.74 
 
 
281 aa  147  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  37.35 
 
 
274 aa  147  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  38.46 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  41.32 
 
 
253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  36.77 
 
 
242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  40.43 
 
 
256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  37.07 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  37.07 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  37.65 
 
 
251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  38.1 
 
 
254 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  35.04 
 
 
285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  38.49 
 
 
253 aa  144  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  39.5 
 
 
247 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3704  protein of unknown function DUF159  37.36 
 
 
283 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  37.5 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  40.28 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  37.12 
 
 
238 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>