224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1704 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  60.57 
 
 		 253 aa  291  8e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  57.79 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  56.63 
 
 		 261 aa  280  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  59.6 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  50.6 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  51 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  51.45 
 
 		 236 aa  228  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  50.6 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  48.09 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  47.64 
 
 		 253 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  51.63 
 
 		 248 aa  214  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  44.8 
 
 		 285 aa  208  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  48.85 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  44.7 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  45.17 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  44.49 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  42.86 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  42.04 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  44.86 
 
 		 222 aa  188  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  42.97 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3704  protein of unknown function DUF159  43.54 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  40.88 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  42.44 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  44.62 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  40.32 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  42.68 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  42.39 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  41.22 
 
 		 226 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  41.8 
 
 		 242 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  40 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  42.68 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  40.96 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  41.8 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  41.2 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  41.18 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  40.65 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  39.51 
 
 		 221 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  40.23 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  39.77 
 
 		 262 aa  164  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  41.6 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  41.08 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  39.62 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  39.62 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  43.32 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  39.57 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  39.53 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  39.43 
 
 		 235 aa  161  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  36.25 
 
 		 238 aa  158  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  35.77 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  39.6 
 
 		 244 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  39.13 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  40.49 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  40.89 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  36.48 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  39.18 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  38.33 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  39.18 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  36.48 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  39.34 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  37.8 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  36.95 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  37.7 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  38.19 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  40.33 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  36.8 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  37.35 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  35.1 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  39.29 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  36.48 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  35.92 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  35.27 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  31.15 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  37.96 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  40.89 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  35.63 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  42.21 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  36.63 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  33.06 
 
 		 222 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  33.06 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  33.06 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  34.44 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  36.33 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  35.25 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  35.52 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  35.63 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  34.29 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  35.1 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  36.63 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  35.39 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10600  hypothetical protein  35.87 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  35.74 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  33.99 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  34.89 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  34.02 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  38.25 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  34.3 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  33.46 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1211  protein of unknown function DUF159  36.61 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.074414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>