256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1122 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  100 
 
 
226 aa  474  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  60.09 
 
 
234 aa  289  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  57.96 
 
 
231 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  40.17 
 
 
227 aa  168  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  43.61 
 
 
223 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  43.37 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  39.33 
 
 
233 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  41.74 
 
 
227 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  39.25 
 
 
244 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  39.57 
 
 
248 aa  157  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  39.39 
 
 
222 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  41.92 
 
 
224 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  43.23 
 
 
222 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  35.77 
 
 
253 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  39.35 
 
 
257 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  39.84 
 
 
233 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  34.8 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  38.5 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  36.71 
 
 
261 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  40.21 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  38.1 
 
 
226 aa  144  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  38.86 
 
 
221 aa  144  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  37.23 
 
 
225 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  36.24 
 
 
221 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  37.99 
 
 
222 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  36.57 
 
 
259 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  33.98 
 
 
290 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  38.84 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  34.72 
 
 
266 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  34.72 
 
 
266 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  34.48 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  38.96 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  34.51 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  39.39 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  38.71 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  37.33 
 
 
222 aa  137  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  37.33 
 
 
222 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  37.33 
 
 
222 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  37.07 
 
 
226 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  33.47 
 
 
252 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  35.78 
 
 
236 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  34.63 
 
 
226 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  36.02 
 
 
235 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  37.29 
 
 
234 aa  136  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  34.98 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  34.98 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  32.58 
 
 
268 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  34.2 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  34.43 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  40.93 
 
 
221 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  36.05 
 
 
254 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  37.39 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  36.84 
 
 
222 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  36.02 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  35.65 
 
 
243 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  39.9 
 
 
252 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  35.54 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  37.33 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  34.3 
 
 
248 aa  128  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  42.46 
 
 
337 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  35.75 
 
 
241 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  36.45 
 
 
231 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  34.05 
 
 
239 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  33.06 
 
 
253 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  35.64 
 
 
240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  39.02 
 
 
253 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  33.89 
 
 
262 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  34.26 
 
 
254 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  36.76 
 
 
255 aa  123  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  39.33 
 
 
338 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  34.48 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  32.74 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  33.9 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  30.92 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  33.77 
 
 
250 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  34.5 
 
 
219 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  34.53 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  33.48 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  32.35 
 
 
259 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  34.71 
 
 
251 aa  118  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  31.88 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  32.31 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  32.4 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  43.97 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  34.5 
 
 
256 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  34.19 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  36.41 
 
 
253 aa  115  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  32.44 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  32.08 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  35.35 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  32.81 
 
 
251 aa  113  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  41.58 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  112  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  31 
 
 
239 aa  111  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  39.39 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  37.02 
 
 
256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  31.4 
 
 
252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  30.34 
 
 
239 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  31.89 
 
 
253 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  29.49 
 
 
242 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>