201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1250 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  98.2 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  97.3 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  96.4 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  96.4 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  95.95 
 
 		 223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  83.78 
 
 		 223 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1095  hypothetical protein  79.08 
 
 		 208 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1129  hypothetical protein  79.08 
 
 		 208 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2031  hypothetical protein  97.18 
 
 		 165 aa  293  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  47.39 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  49.56 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  46.49 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1711  hypothetical protein  45.78 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  44.78 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  46.09 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2746  hypothetical protein  45.98 
 
 		 221 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2941  hypothetical protein  45.98 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433222  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2834  hypothetical protein  45.54 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263955  normal  0.106264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3296  hypothetical protein  40.71 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2433  hypothetical protein  42.79 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0734  hypothetical protein  47.22 
 
 		 147 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1349  hypothetical protein  37.19 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2778  protein of unknown function DUF159  36.84 
 
 		 240 aa  134  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  36.49 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1882  hypothetical protein  87.69 
 
 		 85 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2209  hypothetical protein  71.76 
 
 		 85 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0237306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  33.19 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  34.65 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  32.9 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  32.46 
 
 		 224 aa  115  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  34.36 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  31.56 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  33.92 
 
 		 257 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  32.46 
 
 		 257 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  32.16 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  33.77 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  32.4 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  34.06 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  31.58 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1918  hypothetical protein  30.13 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.78991 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  35.27 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  33.63 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  33.48 
 
 		 239 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1263  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  33.2 
 
 		 252 aa  101  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  31.95 
 
 		 268 aa  101  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  33.72 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  29.82 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2605  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  31.06 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  33.08 
 
 		 266 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  33.08 
 
 		 266 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  31.44 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  30.26 
 
 		 248 aa  99  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  29.57 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  31.68 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  30.7 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  30.65 
 
 		 253 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  31.93 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  31.09 
 
 		 259 aa  95.5  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  32.08 
 
 		 254 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  31 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  28.95 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  29.2 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  32.5 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  30.98 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  30.9 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  31.6 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  30.9 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  34.6 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  31.28 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  29.96 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  32.81 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  31.75 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  32.55 
 
 		 261 aa  92.4  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  31.78 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  29.2 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  29.65 
 
 		 227 aa  91.7  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  30.26 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  31.6 
 
 		 217 aa  91.7  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  91.7  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  27.75 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  31.65 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  32.49 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  31.67 
 
 		 262 aa  89.4  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  29.69 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  30.8 
 
 		 253 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  29.39 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  32.26 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  31.62 
 
 		 268 aa  88.6  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  30.11 
 
 		 281 aa  88.2  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  30.47 
 
 		 274 aa  88.2  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  30.63 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  27.95 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  29.11 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  32.14 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  28.81 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  31.09 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  30.9 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>