22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1882 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1882  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  179  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  87.69 
 
 		 222 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  87.69 
 
 		 222 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  87.69 
 
 		 223 aa  127  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  87.69 
 
 		 223 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2031  hypothetical protein  87.69 
 
 		 165 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  87.69 
 
 		 223 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  87.69 
 
 		 222 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  80 
 
 		 223 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1129  hypothetical protein  78.46 
 
 		 208 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1095  hypothetical protein  78.46 
 
 		 208 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2209  hypothetical protein  67.16 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0237306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  50.77 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1711  hypothetical protein  43.08 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  40 
 
 		 242 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  43.08 
 
 		 229 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  38.46 
 
 		 239 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  41.54 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2941  hypothetical protein  40.91 
 
 		 261 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433222  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3296  hypothetical protein  30.77 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2746  hypothetical protein  35.38 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2834  hypothetical protein  35.38 
 
 		 229 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263955  normal  0.106264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>