196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1129 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1095  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1129  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  88.2 
 
 		 223 aa  337  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  85.39 
 
 		 222 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  85.39 
 
 		 223 aa  327  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  85.39 
 
 		 223 aa  327  8e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  85.39 
 
 		 222 aa  327  9e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  79.08 
 
 		 222 aa  326  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  78.57 
 
 		 223 aa  323  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2031  hypothetical protein  83.8 
 
 		 165 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1711  hypothetical protein  46.99 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  48.62 
 
 		 229 aa  157  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  44.32 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  46.6 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2834  hypothetical protein  47.49 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263955  normal  0.106264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  41.15 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  39.79 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2941  hypothetical protein  45.56 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433222  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2746  hypothetical protein  44.81 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2209  hypothetical protein  77.65 
 
 		 85 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0237306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2433  hypothetical protein  43.41 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3296  hypothetical protein  39.23 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2778  protein of unknown function DUF159  40.91 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1349  hypothetical protein  39.22 
 
 		 240 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1882  hypothetical protein  78.46 
 
 		 85 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0734  hypothetical protein  47.62 
 
 		 147 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  35.75 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  31.55 
 
 		 224 aa  95.9  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  34.95 
 
 		 259 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  32.98 
 
 		 255 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  30.58 
 
 		 223 aa  91.7  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  32.98 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  35.14 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  30.27 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  31.48 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  32.46 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  35.47 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  32.47 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  32.26 
 
 		 259 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  85.9  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30.81 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  30.81 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  34.76 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  31.32 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  30.88 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  30.8 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  33.51 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  29.15 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  30.81 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  29.74 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  30.5 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  29.74 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  28.05 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  32.26 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  31.47 
 
 		 259 aa  81.3  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  32.07 
 
 		 237 aa  81.3  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  30.22 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  29.59 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2210  hypothetical protein  66.67 
 
 		 57 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0527992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  34.55 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  31.15 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  32.99 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  29.61 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  29.21 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  31.38 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  31.22 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  33.49 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  31.03 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  30.88 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  32.71 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  32.71 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  31.88 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  30.95 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  31.35 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  24.09 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  31.55 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  28.24 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  30.57 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  27.57 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  27.57 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  27.78 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  29.58 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  30.65 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  29.23 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  27.03 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  29.89 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  28.72 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  31.02 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  27.07 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  29.56 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  31.96 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  30.6 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  31.79 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  29.38 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  27.62 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  29.9 
 
 		 250 aa  71.2  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  29.41 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>