191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2433 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2433  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2941  hypothetical protein  61.5 
 
 
261 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433222  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2746  hypothetical protein  61.06 
 
 
221 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2834  hypothetical protein  61.06 
 
 
229 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263955  normal  0.106264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3296  hypothetical protein  57.33 
 
 
226 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  49.78 
 
 
242 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  50.22 
 
 
239 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  50.44 
 
 
229 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  48.03 
 
 
230 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  44.59 
 
 
237 aa  188  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1711  hypothetical protein  46.7 
 
 
229 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501792  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  44.05 
 
 
223 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  43.67 
 
 
222 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  43.67 
 
 
222 aa  167  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  43.23 
 
 
223 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  43.67 
 
 
223 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  43.23 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  42.79 
 
 
222 aa  164  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1349  hypothetical protein  35 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2778  protein of unknown function DUF159  34.85 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1095  hypothetical protein  43.41 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1129  hypothetical protein  43.41 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0734  hypothetical protein  47.55 
 
 
147 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  33.04 
 
 
238 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  34.2 
 
 
232 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  34.39 
 
 
268 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  30.21 
 
 
240 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  36.56 
 
 
217 aa  105  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  32.17 
 
 
221 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  32.17 
 
 
222 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  35.06 
 
 
248 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  31.01 
 
 
256 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  32.61 
 
 
239 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  35.27 
 
 
231 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  32.93 
 
 
253 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  34.04 
 
 
239 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  34.47 
 
 
259 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  34.22 
 
 
281 aa  99.4  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  33.61 
 
 
236 aa  99  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  32.76 
 
 
217 aa  99.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  33.04 
 
 
222 aa  98.6  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  32.03 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  32.91 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  31.93 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  33.19 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  32.92 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  95.1  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  33.47 
 
 
252 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  33.61 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  32.61 
 
 
259 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  31.05 
 
 
252 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  30.8 
 
 
338 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  33.62 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  33.19 
 
 
221 aa  92.4  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  31 
 
 
248 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  33.62 
 
 
257 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  32.98 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  30.59 
 
 
274 aa  90.9  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  32.59 
 
 
337 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  31.45 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  30.67 
 
 
226 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  29.31 
 
 
226 aa  89  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1263  hypothetical protein  31.25 
 
 
229 aa  89  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  31.52 
 
 
261 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  31.43 
 
 
254 aa  89  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  30.61 
 
 
253 aa  88.6  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  33.19 
 
 
254 aa  88.6  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  34.69 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  33.17 
 
 
255 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  32.23 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  32.39 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  33.18 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  33.18 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  33.76 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  33.17 
 
 
243 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  33.65 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  31.3 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2605  hypothetical protein  31.38 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  32.11 
 
 
253 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  31.44 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  30.12 
 
 
253 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  30.52 
 
 
252 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  30.46 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1918  hypothetical protein  31.62 
 
 
229 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.78991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  34.52 
 
 
254 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  31.8 
 
 
261 aa  85.5  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2031  hypothetical protein  38.3 
 
 
165 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  30.24 
 
 
251 aa  85.5  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  31.49 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  32.37 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  30.92 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  30.34 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  30 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  30.43 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  30.43 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  28.86 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  32.06 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  30.42 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  32.64 
 
 
191 aa  82  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>