190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3296 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3296  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2941  hypothetical protein  62.78 
 
 		 261 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433222  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2746  hypothetical protein  62.33 
 
 		 221 aa  287  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2834  hypothetical protein  59.46 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263955  normal  0.106264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2433  hypothetical protein  57.33 
 
 		 230 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  45.85 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  44.35 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  43.23 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1711  hypothetical protein  43.36 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  40.97 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  39.57 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  41.23 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  40.71 
 
 		 222 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  40.71 
 
 		 222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  40.27 
 
 		 222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  40.53 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  40.09 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  40.09 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2778  protein of unknown function DUF159  33.47 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1129  hypothetical protein  39.23 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1095  hypothetical protein  39.23 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0734  hypothetical protein  43.06 
 
 		 147 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1349  hypothetical protein  33.06 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  32.66 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  32.55 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  30.61 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  30.89 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  30.3 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  32.76 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  31.98 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2031  hypothetical protein  40.15 
 
 		 165 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  32.16 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  29.2 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  32.17 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  29.62 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  29.66 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  28.46 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  28.14 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  35.06 
 
 		 259 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  32.34 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  30.32 
 
 		 231 aa  91.7  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  31.74 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  31.65 
 
 		 266 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  31.65 
 
 		 266 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  29.64 
 
 		 261 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  31.73 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  27.2 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  32.2 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  30.17 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  32.93 
 
 		 253 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  28.32 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  28.39 
 
 		 252 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  31.88 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1263  hypothetical protein  32.14 
 
 		 229 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  30.94 
 
 		 338 aa  88.6  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2605  hypothetical protein  31.63 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  29.75 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  32.06 
 
 		 248 aa  87.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  34.52 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  29.06 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  31.09 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  30.77 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  31.33 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  31.96 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  30.77 
 
 		 226 aa  85.5  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  29.5 
 
 		 261 aa  85.1  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  32.17 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  27.83 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  32.79 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  30.2 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  29.67 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  32.99 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  31.98 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  31.63 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  27.59 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  31.25 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  28.51 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  31.35 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  29.36 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  28.12 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  32.75 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  32.02 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  31.58 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1918  hypothetical protein  31.12 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.78991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  28.15 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  28.94 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  27.73 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  28.21 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  31.38 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  28.94 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  32.79 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  32.7 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  28.74 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  29.39 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  32.31 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  30 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  30.87 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  29.07 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>