223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3924 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  460  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  38.07 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  38.16 
 
 		 210 aa  117  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  36.53 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  31.75 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0311  hypothetical protein  32.21 
 
 		 197 aa  94.7  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  32.23 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3234  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  32.86 
 
 		 238 aa  92.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0315  hypothetical protein  32.21 
 
 		 197 aa  92  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3039  hypothetical protein  34.53 
 
 		 189 aa  92  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  30.04 
 
 		 254 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  30.7 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  30.7 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  30.67 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  30.05 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30.14 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  29.6 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  30.38 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  28.25 
 
 		 255 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  34.52 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04880  hypothetical protein  27.41 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  32.34 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  36.44 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  31.71 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  35.71 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  34.59 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  30.22 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  31.11 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  33.78 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  37.98 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1551  protein of unknown function DUF159  33.96 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0992681  normal  0.026854 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  34.03 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  32.19 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  29.03 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  34.43 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  39.13 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  34.43 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  34.43 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  26.84 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  34.78 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  29.96 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  30.95 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  34.38 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  27.35 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  32.91 
 
 		 257 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  25.65 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  38.26 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  26.32 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  34.53 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  34.78 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  29.12 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  26.32 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  26.32 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  32.75 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  26.32 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  42.86 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  33.76 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  25.79 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  30.61 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  31.55 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  39.05 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  34.51 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1095  hypothetical protein  24.09 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1129  hypothetical protein  24.09 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  28.37 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  30.56 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  35 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  30.2 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  36.03 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  28.79 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  28.1 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  27.53 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  29.53 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  27.14 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  34.68 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  27.94 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  36.22 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  30.85 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  37.1 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  34.21 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  32.69 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3992  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  34.43 
 
 		 262 aa  72  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  27.23 
 
 		 254 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  28.77 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2115  protein of unknown function DUF159  27.46 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  29.75 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  30.37 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  32.92 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  29.73 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  31.3 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  28.44 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  33.1 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  33.54 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0386  hypothetical protein  29.44 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782275  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  27.08 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  26.19 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>