211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3039 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3039  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  393  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0311  hypothetical protein  56.52 
 
 		 197 aa  224  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3234  hypothetical protein  58.01 
 
 		 190 aa  222  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0315  hypothetical protein  55.98 
 
 		 197 aa  221  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3992  hypothetical protein  43 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  34.18 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  33.01 
 
 		 234 aa  101  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30.26 
 
 		 227 aa  95.9  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  32 
 
 		 257 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  34.53 
 
 		 220 aa  92  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  32.28 
 
 		 233 aa  91.7  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  33.16 
 
 		 221 aa  91.3  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  32.47 
 
 		 195 aa  91.3  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  33.15 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  29.19 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  38.52 
 
 		 253 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  33.16 
 
 		 239 aa  89.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  32.6 
 
 		 227 aa  89  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2115  protein of unknown function DUF159  30.05 
 
 		 213 aa  88.6  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  31.82 
 
 		 248 aa  88.2  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  31.77 
 
 		 238 aa  88.6  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  31.11 
 
 		 223 aa  87.8  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  30.43 
 
 		 259 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  38.46 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  31.15 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  29.71 
 
 		 259 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  26.2 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  30.6 
 
 		 224 aa  85.9  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  29.83 
 
 		 221 aa  85.9  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  31.79 
 
 		 220 aa  85.9  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  32.04 
 
 		 239 aa  85.5  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  28.65 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  30.89 
 
 		 219 aa  85.1  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  31.15 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  31.15 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  30.69 
 
 		 232 aa  85.1  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  36.72 
 
 		 226 aa  84.7  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  30.73 
 
 		 224 aa  84.7  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  35.25 
 
 		 217 aa  84.3  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  27.41 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  33.11 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  28.9 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2433  hypothetical protein  34.93 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  29.38 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  31.82 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  29.08 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  36.76 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  28.35 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  28.42 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  28.92 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  30.61 
 
 		 254 aa  77.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  30.11 
 
 		 248 aa  77.8  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  26.26 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  28.49 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  29.14 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  29.56 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  27.7 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  29.82 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  26.04 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  28.71 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  28.04 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  27.22 
 
 		 241 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  26.34 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  25.37 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  23.12 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  31.51 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  29.19 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  32.28 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  32.48 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  33.12 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  33.73 
 
 		 253 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  28.77 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  26.42 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  32.09 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  29.26 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  27.78 
 
 		 237 aa  72  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  30.77 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  32.33 
 
 		 250 aa  72  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  31.54 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  31.78 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0871629 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  30.77 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  29.22 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  24.74 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  31.54 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  32.56 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  28.77 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  33.61 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  30.77 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  32.48 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  31.54 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  28.77 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1551  protein of unknown function DUF159  32.85 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0992681  normal  0.026854 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1263  hypothetical protein  31.22 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  36.57 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  28.97 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  28.97 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1918  hypothetical protein  30.48 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.78991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  28.43 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04880  hypothetical protein  29.51 
 
 		 220 aa  67.8  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2605  hypothetical protein  31.22 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>