209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3234 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3234  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  400  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3039  hypothetical protein  58.01 
 
 		 189 aa  222  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0311  hypothetical protein  53.85 
 
 		 197 aa  214  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0315  hypothetical protein  52.31 
 
 		 197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3992  hypothetical protein  46.7 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  35.12 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  34.85 
 
 		 226 aa  104  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  32.32 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  28.19 
 
 		 234 aa  98.6  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  35.62 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  32.78 
 
 		 259 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  31 
 
 		 222 aa  92.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  29 
 
 		 222 aa  91.7  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  29.08 
 
 		 226 aa  90.5  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  29.95 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  29.5 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  29.85 
 
 		 244 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  31.84 
 
 		 223 aa  89  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  32.22 
 
 		 259 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  31.75 
 
 		 239 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  32.62 
 
 		 220 aa  88.2  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  30.37 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  29.81 
 
 		 254 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  32.96 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  31.71 
 
 		 254 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  31.79 
 
 		 238 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  34.71 
 
 		 227 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  28 
 
 		 262 aa  86.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  28.85 
 
 		 252 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  32.49 
 
 		 239 aa  85.5  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  29.63 
 
 		 233 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  26.22 
 
 		 247 aa  84.7  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  30.22 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  30.22 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  34.33 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  29.55 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  32.02 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  24.51 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  26.29 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  31.43 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2433  hypothetical protein  27.41 
 
 		 230 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  26.74 
 
 		 227 aa  80.9  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  34.13 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  31.94 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2115  protein of unknown function DUF159  27.86 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  34.13 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  34.13 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  29.41 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  30.2 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  28.5 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  28.65 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  28.49 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  36.75 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  30 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  31.4 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  29.49 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  28.71 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  29.28 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  27.36 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  29.89 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  34.84 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  27.18 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  27.6 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  29.74 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  26.77 
 
 		 248 aa  78.2  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  27.92 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  28.65 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  28.75 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  28.33 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  28.43 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  27.8 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  27.14 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  28.21 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  25.39 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  27.91 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  30.53 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  23.58 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  31.55 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  26.55 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  29.08 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  33.59 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  27.17 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  32 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  27.53 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  30.05 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  28.43 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  28.18 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  35.83 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  27.67 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  28.89 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  29.59 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  31.01 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0800  hypothetical protein  27.69 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2834  hypothetical protein  26.32 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263955  normal  0.106264 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  24.42 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1711  hypothetical protein  30.11 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  28.47 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>