210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0311 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0311  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0315  hypothetical protein  95.43 
 
 		 197 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3039  hypothetical protein  56.52 
 
 		 189 aa  224  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3234  hypothetical protein  53.85 
 
 		 190 aa  214  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3992  hypothetical protein  46.12 
 
 		 210 aa  184  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  36 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  35.82 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  34.67 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  34.01 
 
 		 244 aa  97.8  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  32.21 
 
 		 220 aa  94.7  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  29.33 
 
 		 261 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30.77 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  32.18 
 
 		 250 aa  92.8  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  29.11 
 
 		 266 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  29.11 
 
 		 266 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  28.72 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  31.82 
 
 		 222 aa  91.3  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  31.31 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  34.24 
 
 		 255 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  33.87 
 
 		 259 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  30.27 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  32.02 
 
 		 252 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  31.51 
 
 		 255 aa  89  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  30.53 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  31.77 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  31.16 
 
 		 254 aa  88.6  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  33.81 
 
 		 233 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  31.32 
 
 		 257 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  33.7 
 
 		 254 aa  87  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  34.01 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  32.46 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  31.75 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  32.63 
 
 		 250 aa  85.5  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  31.63 
 
 		 239 aa  85.1  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  29.8 
 
 		 234 aa  85.1  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  36.14 
 
 		 253 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  35.66 
 
 		 261 aa  85.1  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  31.71 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  32.46 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  32.46 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  29.72 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  31.72 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  32.37 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  31.72 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  34.18 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  31.68 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  33.12 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  30.59 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  29.11 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  28.8 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  32.45 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  28.88 
 
 		 241 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  30.35 
 
 		 252 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  29.15 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  30.51 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  29.76 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  29.57 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  33.15 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  34.55 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  27.91 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  31.18 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  30.48 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  30.96 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  29.17 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  37.6 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  29.5 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  31.14 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  34.42 
 
 		 254 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  29.95 
 
 		 254 aa  77.8  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  29.25 
 
 		 235 aa  77.8  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  30.81 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  31 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  28.64 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  29.8 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  29.57 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  32.47 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  25.87 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  33.57 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  32.45 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  31.09 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  30.33 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1551  protein of unknown function DUF159  33.08 
 
 		 258 aa  74.7  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0992681  normal  0.026854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  27.85 
 
 		 247 aa  74.7  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  30.73 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  32.17 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2115  protein of unknown function DUF159  28.88 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  29.95 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  28.92 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0386  hypothetical protein  28.35 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782275  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  31.18 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  34.2 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  30.1 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  27.49 
 
 		 248 aa  72  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  31.1 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  30.65 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  27.6 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  35.94 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  30.3 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  30.05 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  30.38 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>