236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2013 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  100 
 
 
206 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  40.78 
 
 
210 aa  158  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  38.73 
 
 
197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  38.07 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  33.65 
 
 
238 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  36.36 
 
 
220 aa  121  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  34.15 
 
 
223 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  34.9 
 
 
226 aa  118  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  34.47 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  32.69 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  32.21 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  32.21 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  34.65 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  36.31 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  30.54 
 
 
222 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  38.96 
 
 
227 aa  111  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  31.91 
 
 
255 aa  111  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  31.4 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  36.05 
 
 
259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  30.39 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  35.96 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  28.9 
 
 
250 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  29.27 
 
 
244 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  32.68 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  31.53 
 
 
234 aa  108  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  30.24 
 
 
233 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  32.31 
 
 
257 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  35.48 
 
 
221 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  31.38 
 
 
254 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  33.49 
 
 
254 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  33.68 
 
 
232 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  31.52 
 
 
224 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  34.21 
 
 
224 aa  104  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  30.1 
 
 
243 aa  104  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  32.55 
 
 
254 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  32.64 
 
 
221 aa  104  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  31.67 
 
 
261 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  31.34 
 
 
241 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  32.72 
 
 
251 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  34 
 
 
233 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  29.89 
 
 
224 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  28.96 
 
 
261 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  30.3 
 
 
253 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  31.22 
 
 
222 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  30.45 
 
 
233 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  31.91 
 
 
243 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  32.35 
 
 
254 aa  101  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  31.53 
 
 
255 aa  101  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  30.85 
 
 
235 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  31.91 
 
 
248 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  28.16 
 
 
248 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  30.26 
 
 
234 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  29.06 
 
 
219 aa  99.8  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  32.65 
 
 
259 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  34.18 
 
 
256 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  32.18 
 
 
232 aa  99.4  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  31.22 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  38.82 
 
 
195 aa  99  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  34.09 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  30.43 
 
 
237 aa  98.6  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  35.67 
 
 
218 aa  98.2  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  31.03 
 
 
243 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  97.1  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  31.22 
 
 
281 aa  97.1  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  29.9 
 
 
252 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  29.89 
 
 
239 aa  95.9  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  28.64 
 
 
253 aa  95.9  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  31.84 
 
 
262 aa  95.5  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  30.48 
 
 
252 aa  95.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  29.63 
 
 
256 aa  95.1  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  28.9 
 
 
251 aa  94.7  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  27.32 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  31.22 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  30.43 
 
 
253 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  29.19 
 
 
239 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  29.15 
 
 
246 aa  92.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  33.52 
 
 
212 aa  92  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  33.17 
 
 
225 aa  92  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  28.08 
 
 
257 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  32.51 
 
 
253 aa  92  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  33.55 
 
 
227 aa  91.3  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0315  hypothetical protein  30.53 
 
 
197 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3039  hypothetical protein  29.19 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  28.14 
 
 
242 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  31.86 
 
 
230 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3234  hypothetical protein  29.95 
 
 
190 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  28.02 
 
 
252 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  28.71 
 
 
248 aa  89.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  35.16 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  29.65 
 
 
231 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0311  hypothetical protein  30.53 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  29.11 
 
 
262 aa  88.2  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  29.44 
 
 
208 aa  88.2  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  29.05 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  32.34 
 
 
231 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  25.27 
 
 
240 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  29.38 
 
 
240 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  25.7 
 
 
268 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  37.4 
 
 
247 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  26.69 
 
 
247 aa  86.7  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.178705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>