200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1580 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1580  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0386  hypothetical protein  46.22 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782275  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1918  hypothetical protein  35.47 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.78991 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1263  hypothetical protein  36.44 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2605  hypothetical protein  35.17 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  31.91 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  35.87 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  31.65 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  33.95 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  40.91 
 
 		 217 aa  92.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  35.18 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  36.77 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  33.18 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  35.59 
 
 		 255 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  34.27 
 
 		 254 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  31.63 
 
 		 232 aa  88.6  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  35.8 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  30.91 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  30.89 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  33.67 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  31.31 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  31.51 
 
 		 244 aa  85.1  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  34.63 
 
 		 243 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  29.36 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  32.92 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  34.1 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  31.12 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  31.42 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  32.69 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  32.06 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  31.34 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  34.01 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  32.43 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  35.03 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  30.36 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  30.36 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  34.15 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  33.12 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  33.79 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  36.14 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  29.29 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  30.98 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  31.67 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  33.85 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  28.85 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  29.91 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  31.03 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  32.88 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  32.58 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  32.2 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  31.8 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  36.42 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  30.39 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  32.54 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  34.15 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  34.33 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  33.89 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  32.09 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  31.28 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  28.74 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  32.14 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  30.67 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  34.34 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  33.54 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  28.29 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  28.02 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  32.84 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  30.96 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  30.2 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  32.18 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  33.17 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  30.52 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  28.45 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  32.22 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  28.73 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  32.02 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  37.72 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  29.08 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0311  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  35 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  27.32 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  32.5 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  28.92 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  31.46 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  27.75 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  28.93 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  28.27 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  28.27 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41280  hypothetical protein  33.77 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  29.44 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  29.39 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  30.97 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  29.67 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0315  hypothetical protein  28.72 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  30.26 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  30.24 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  29.91 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  29.12 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  32.99 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>