166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5645 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  100 
 
 
215 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  91.12 
 
 
215 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  84.58 
 
 
214 aa  351  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  74.65 
 
 
219 aa  323  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  71.16 
 
 
222 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  94.19 
 
 
232 aa  303  9.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  59.82 
 
 
230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  61.27 
 
 
244 aa  244  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  55.91 
 
 
217 aa  214  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  48.36 
 
 
244 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  55 
 
 
217 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  52.29 
 
 
215 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  55.87 
 
 
220 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  50.46 
 
 
229 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  50.66 
 
 
226 aa  202  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  47.54 
 
 
244 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  50.92 
 
 
222 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  49.53 
 
 
210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  45.27 
 
 
246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  45.27 
 
 
241 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  44.4 
 
 
241 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  45.27 
 
 
256 aa  187  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  42.15 
 
 
219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  43.33 
 
 
208 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  37.76 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  49.11 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  40.99 
 
 
223 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  33.97 
 
 
216 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0838  hypothetical protein  88.64 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  31.03 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  32.08 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  30.2 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  31.38 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  31.67 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  34.43 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  32.69 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  30.33 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  29.58 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  31.92 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  31.31 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  36.31 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  32.83 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  32.24 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  31.16 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  32.08 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  33.18 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  52.17 
 
 
74 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  37.17 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  29.44 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  30.58 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  29.82 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  30.14 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  28.93 
 
 
259 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  29.91 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  29.05 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  30.74 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  32.2 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  29.44 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  31.9 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  30.17 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  28.97 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  32.6 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  29.11 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  30.19 
 
 
226 aa  64.7  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  27.94 
 
 
259 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  31.28 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  30.26 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  29.26 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  25.88 
 
 
247 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  25.68 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  29.1 
 
 
257 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  32.02 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  29.53 
 
 
235 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  27.7 
 
 
222 aa  62  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  26.89 
 
 
221 aa  61.6  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  31.1 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  30.37 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  27.83 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  30.58 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  29.47 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  28.11 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  29.57 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  30.87 
 
 
222 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  25.12 
 
 
222 aa  59.3  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  27.62 
 
 
221 aa  58.9  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  26.57 
 
 
243 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  25.12 
 
 
222 aa  58.2  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  25.12 
 
 
222 aa  58.2  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  29.58 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  30.11 
 
 
346 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  29.7 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  33.75 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  27.48 
 
 
253 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  32.32 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  28.31 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  27.27 
 
 
196 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  28.69 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  30.52 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  28.84 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  56.6 
 
 
177 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>