175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6967 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  100 
 
 
198 aa  413  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  63.27 
 
 
197 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  62.76 
 
 
197 aa  264  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  57.79 
 
 
199 aa  251  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  43 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  39 
 
 
196 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  41.5 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  34.85 
 
 
236 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2283  hypothetical protein  34.69 
 
 
168 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.353582 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  29.41 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  32.67 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  32.54 
 
 
240 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  35.23 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  30.69 
 
 
238 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  37.61 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  30 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  29.31 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  30.58 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  31.87 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  43.12 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  31.03 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  35.76 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  29.94 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  31.58 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  29.52 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  30.32 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  41.57 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  29.12 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  26.23 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  30.23 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  34.31 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  35 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  28.91 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  28.93 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  36.04 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  27.14 
 
 
226 aa  64.7  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  27.93 
 
 
233 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  32.87 
 
 
248 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  33.91 
 
 
226 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  38.4 
 
 
234 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  34.51 
 
 
234 aa  62.4  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  30.65 
 
 
230 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2115  protein of unknown function DUF159  29.44 
 
 
213 aa  61.6  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 
222 aa  61.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  37.17 
 
 
210 aa  61.2  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  37.93 
 
 
227 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 
232 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  29.24 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  29.71 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  33.62 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  31.43 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  28.57 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  28.57 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  28.16 
 
 
346 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  28.72 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  28.95 
 
 
248 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04880  hypothetical protein  25.53 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  30.25 
 
 
261 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  32.4 
 
 
216 aa  58.9  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  32.21 
 
 
224 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  29.19 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  38.21 
 
 
222 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  32.48 
 
 
231 aa  58.2  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  29.63 
 
 
239 aa  58.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1551  protein of unknown function DUF159  29.86 
 
 
258 aa  58.2  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0992681  normal  0.026854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  28.39 
 
 
247 aa  57.4  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  28.74 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  32.73 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  28.83 
 
 
226 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  33.11 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  29.73 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  30.51 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  30.22 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  27.89 
 
 
268 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  26.15 
 
 
238 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  30.94 
 
 
233 aa  55.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  32.1 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  28.43 
 
 
226 aa  55.5  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  29.94 
 
 
260 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  30.94 
 
 
238 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  34.02 
 
 
232 aa  54.7  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  35.85 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  30.61 
 
 
338 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  37.36 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  27.27 
 
 
242 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3992  hypothetical protein  26.11 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  27.66 
 
 
225 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  29.71 
 
 
218 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  27.66 
 
 
225 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  26.67 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  30.99 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  34.55 
 
 
247 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  23.98 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0200  hypothetical protein  29.29 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.189466 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  33.96 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  28.57 
 
 
244 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  33.96 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  28.37 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  37.5 
 
 
212 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  37.5 
 
 
212 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>