111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0200 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0200  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  424  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.189466 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1551  protein of unknown function DUF159  36 
 
 		 258 aa  99.4  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0992681  normal  0.026854 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04880  hypothetical protein  29.15 
 
 		 220 aa  89.4  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  28.82 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  37.66 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  29.45 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  29.53 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  28.48 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  30.32 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  27.32 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  26.4 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  28.79 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  27.54 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  27.45 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  29.01 
 
 		 254 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  27.69 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  28.03 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  27.89 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  28.83 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  30.43 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  27.08 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  25.81 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  29.29 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  30.87 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  25 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  29.29 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  26.04 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  25.13 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  28.22 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  30.71 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  22.64 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  26.13 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  26.8 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  25.64 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  25.51 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  28.47 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  29.41 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  30.97 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  26.53 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  26.82 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  26.04 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  25.5 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  29.41 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  25.77 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  28.77 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0311  hypothetical protein  22.92 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  29.52 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  27.18 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  22.89 
 
 		 259 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  30.72 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  29.79 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  27.34 
 
 		 259 aa  48.1  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  26.92 
 
 		 259 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  23.86 
 
 		 239 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  24.23 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  26.09 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3234  hypothetical protein  25.33 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  26.38 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  24.4 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  24.23 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  24.23 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  28.87 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  29.86 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  23.08 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  25.48 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  23.96 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  24.18 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  25.62 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  26.15 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  24.49 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  29.55 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  26.15 
 
 		 252 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  24.83 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  25.16 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  24.88 
 
 		 254 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  26.15 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  26.15 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  30.17 
 
 		 219 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  21.67 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1095  hypothetical protein  23.94 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1129  hypothetical protein  23.94 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  24.34 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  26.56 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  23.2 
 
 		 236 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  26.67 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  27.27 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  28.33 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0315  hypothetical protein  22.92 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  29.01 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  23.33 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2283  hypothetical protein  22.3 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  27.64 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  23.76 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3039  hypothetical protein  25.3 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  24.75 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  25 
 
 		 290 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  23.12 
 
 		 253 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  23.95 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.590948 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>