125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0811 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  83.98 
 
 
256 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  50.65 
 
 
230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  53.02 
 
 
244 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  52.53 
 
 
210 aa  217  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  46.22 
 
 
241 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  50.93 
 
 
220 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  52.09 
 
 
222 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  50.46 
 
 
215 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  51.18 
 
 
222 aa  201  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  48.62 
 
 
215 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  49.29 
 
 
219 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  43.75 
 
 
244 aa  191  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  45.76 
 
 
241 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  45.12 
 
 
246 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  48.58 
 
 
214 aa  187  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  46.79 
 
 
217 aa  187  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  47.44 
 
 
215 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  47.25 
 
 
217 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  48.88 
 
 
226 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  43.33 
 
 
244 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  54.76 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  45.83 
 
 
208 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  54.3 
 
 
232 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  37.74 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  41.28 
 
 
219 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  38.46 
 
 
223 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  39.83 
 
 
151 aa  85.9  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  53.42 
 
 
74 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  30.73 
 
 
216 aa  79  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  29.17 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  28.77 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  30.33 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  31.34 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30.1 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  30.84 
 
 
255 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  31.52 
 
 
220 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  43.82 
 
 
177 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  28.63 
 
 
244 aa  62  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  30.09 
 
 
254 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  29.73 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  28.24 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  27.72 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  28.57 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  27.32 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  25 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  25.73 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  25.12 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  32.56 
 
 
165 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  26.04 
 
 
218 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  23.96 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  26.72 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  27.85 
 
 
226 aa  55.5  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  27.27 
 
 
255 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  28.96 
 
 
197 aa  55.5  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  28.44 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  25.25 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  26.96 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  26.56 
 
 
234 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  27.15 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  25.58 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  27.49 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  23.92 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  25 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  25.78 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  27.93 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  27.54 
 
 
222 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  32.43 
 
 
233 aa  52  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  50 
 
 
98 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  24.66 
 
 
227 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  25.83 
 
 
224 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  24.14 
 
 
233 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  27.75 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  25.24 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  26.98 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  27.4 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  26.6 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  27.46 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  26.03 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  25.11 
 
 
254 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  26.79 
 
 
266 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  26.79 
 
 
266 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  26.26 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  24.87 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  24.88 
 
 
221 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  25.57 
 
 
230 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2283  hypothetical protein  26.94 
 
 
168 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.353582 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  26.58 
 
 
196 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  25.89 
 
 
232 aa  48.5  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  28.87 
 
 
252 aa  48.5  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  27.48 
 
 
261 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  28.11 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  34.48 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0200  hypothetical protein  24.4 
 
 
203 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.189466 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  28.48 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  23.11 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  23.16 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  26.82 
 
 
236 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.381405 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>