164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0573 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  84.58 
 
 		 215 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  84.11 
 
 		 215 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  74.54 
 
 		 219 aa  317  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  73.02 
 
 		 222 aa  313  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  85.81 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  57.02 
 
 		 230 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  59.11 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  52.75 
 
 		 215 aa  215  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  55 
 
 		 217 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  46.47 
 
 		 241 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  54.09 
 
 		 217 aa  207  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  45.9 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  49.07 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  45.45 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  50 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  45.23 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  52.58 
 
 		 220 aa  194  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  49.06 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  48.47 
 
 		 226 aa  191  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  45.19 
 
 		 256 aa  184  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  41.91 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  43.95 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  46.67 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  36.76 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  42.34 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  46.15 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  35.44 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  33.83 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  34.29 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  30.05 
 
 		 238 aa  81.3  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0838  hypothetical protein  79.17 
 
 		 129 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  31.96 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  33.16 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  31.86 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  29.58 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  29.77 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  30.97 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  32.99 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  32.21 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  32.17 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  32.23 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  31.42 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  31.78 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  31.28 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  35 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  30.1 
 
 		 255 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  32.56 
 
 		 254 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  30.73 
 
 		 257 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  33.52 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  50.72 
 
 		 74 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  32.5 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  30.9 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  28.04 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  28.45 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  30.74 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  30.84 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  29.28 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  31.4 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  31.3 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  29.73 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  32.95 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  32.09 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  28.04 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  31.87 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  32.08 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  31.25 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  30.29 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  30.41 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  29.91 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  30.14 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  28.64 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  35.67 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  29.67 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30.05 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  29.26 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  27.01 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  29.58 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  27.4 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  27.7 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  29.13 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  32.02 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  26.07 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  26.07 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  26.07 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  31.96 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  31.11 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  29.69 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  26.98 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  31.64 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  26.85 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  30.51 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  27.1 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  31.36 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  29.58 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  28.5 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  30.63 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  27.66 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  27.59 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>