156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3283 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  45.83 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  46.45 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  40.74 
 
 		 256 aa  154  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  43.33 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  44.86 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  43.33 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  42.45 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  43.78 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  42.72 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  39.29 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  39.91 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  42.31 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  38.89 
 
 		 244 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  41.78 
 
 		 217 aa  131  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  40.38 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  37.5 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  40.85 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  39.38 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  36.64 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  48.25 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  34.91 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  39.72 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  33.62 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  36.76 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  31.76 
 
 		 257 aa  94.7  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  36.27 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  36.11 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  40.65 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  36.36 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  32.56 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  35.43 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  31.79 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  29.22 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  26.74 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  25.86 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  29.56 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  30.81 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  29.12 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  28.92 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  29.13 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  32.72 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  33.7 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  28.37 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  30.93 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  30.81 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  32.22 
 
 		 243 aa  62  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  30.73 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  25.76 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  29.23 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  32.48 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  29.47 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  25.5 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  28.35 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  27.49 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  31.31 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  26.9 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  31.67 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  35.91 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  31.31 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  36.27 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  32.21 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  29 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  28.47 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  28.14 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  29.53 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  28.02 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  28.02 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  26.8 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  28.34 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  25.87 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  30.37 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2115  protein of unknown function DUF159  25 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  28.7 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  31.66 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  27.54 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  28.02 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  26.99 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  31.54 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  29.31 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  26.44 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04880  hypothetical protein  32.54 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  25.45 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  27.16 
 
 		 266 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  27.16 
 
 		 266 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  26.06 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  24.48 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  32.51 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  27.39 
 
 		 261 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  27.18 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  26.55 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  29.67 
 
 		 268 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  27.6 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  29.13 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  30.67 
 
 		 222 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  30.66 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  26 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  27.86 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>