141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3882 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  77.67 
 
 		 219 aa  346  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  71.16 
 
 		 215 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  69.59 
 
 		 215 aa  307  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  72.56 
 
 		 214 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  74.68 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  60.49 
 
 		 244 aa  240  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  55.65 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  48.77 
 
 		 244 aa  214  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  46.37 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  52.78 
 
 		 210 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  46.91 
 
 		 246 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  51.74 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  46.72 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  54.71 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  45.49 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  49.56 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  51.18 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  51.58 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  53.81 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  45.67 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  44.86 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  38.26 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  48.54 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  40.97 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  39.73 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  39.64 
 
 		 151 aa  84.7  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  54.55 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  29.29 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  30.88 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  30.87 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  33.12 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  30.5 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  30.96 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  30 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  29.33 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  28.77 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  28.43 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  27.14 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  32.3 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  30 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  30.14 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  28.64 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  31.93 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  28.04 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0838  hypothetical protein  65.12 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  32.46 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  29.5 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  29 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  31.03 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  30.59 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  30.04 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  27.83 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  29.63 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  24.88 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  29.76 
 
 		 199 aa  62  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  29.17 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  25.33 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  30.15 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  30.81 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  26.85 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  27.83 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  28.72 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  31.58 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  28.14 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  31.63 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  27.53 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  59.62 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  29.25 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  29.89 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  28.24 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  30.67 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  24.75 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  30.16 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  29.12 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  28.51 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  30.32 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  28.44 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  29.17 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  28.27 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  23.66 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  26.37 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  25.3 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  29.51 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  27.19 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  28.27 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  27.23 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  27.95 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  26.79 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  26.94 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  26.19 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  26.36 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  29.2 
 
 		 281 aa  52  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  32.08 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  25.79 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  59.09 
 
 		 98 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  24.75 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  30.37 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>