30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3770 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  311  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  78.15 
 
 		 244 aa  203  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  77.31 
 
 		 244 aa  201  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  70.23 
 
 		 241 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  71.43 
 
 		 241 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  65.55 
 
 		 246 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  52.1 
 
 		 222 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  55.56 
 
 		 257 aa  110  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  45.83 
 
 		 210 aa  107  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  40.65 
 
 		 226 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  42.86 
 
 		 217 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  42.5 
 
 		 215 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  42.02 
 
 		 217 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  39.83 
 
 		 229 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  39.64 
 
 		 222 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  39.83 
 
 		 256 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  42.37 
 
 		 230 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  38.26 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  42.02 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  39.5 
 
 		 220 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  35 
 
 		 214 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  35.65 
 
 		 215 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  37.17 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1998  hypothetical protein  58.7 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  35.78 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  32.14 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  31.93 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  45.45 
 
 		 223 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  28.81 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  38.46 
 
 		 232 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>