179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4144 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  42.34 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  39.47 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  41.1 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  40.99 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  40.09 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  40.91 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  40.62 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  38.46 
 
 		 229 aa  118  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  37.55 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  42.65 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  39.73 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  34.73 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  39.64 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  35.6 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  34.55 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  39.19 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  34.1 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  35.71 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  34.29 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  35.91 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  35.35 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  36.89 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  34.73 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  37.9 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  31.84 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  36.11 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  31.48 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  32.98 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  34.58 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  39.77 
 
 		 220 aa  88.6  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  35.62 
 
 		 346 aa  86.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  33.78 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  33.64 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  45.45 
 
 		 232 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  31 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  34.2 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  34.43 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  31.46 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  28.9 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  32.43 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  31.8 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  34.87 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  33.18 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  35.23 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  35.21 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  31.96 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  32.11 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  33.7 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  27.59 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  31.84 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  28.82 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  29.86 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  27.44 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  30.13 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  32.14 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  39.17 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  30 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  28.83 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  34.1 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  32.93 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  30.35 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  31.4 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  31.72 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  29.74 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  31.14 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  32.08 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  26.72 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  30.59 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  42.02 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  30.59 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  31.22 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  29.63 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  31.22 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  28.77 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  30.77 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  31.29 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  30.82 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  29.17 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  29.63 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  32.89 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  30.37 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  28.02 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  31.29 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  33.75 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  29.17 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  31.38 
 
 		 247 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  32.49 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  26.24 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  26.24 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  29.82 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  33.11 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  29.41 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  30.69 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  29.3 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  28.04 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  31.25 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  43.59 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  29.36 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  26.99 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>