118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3340 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  66.23 
 
 		 230 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  58.57 
 
 		 244 aa  238  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  48.99 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  54.84 
 
 		 215 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  55.87 
 
 		 215 aa  224  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  50 
 
 		 241 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  51.03 
 
 		 246 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  52.53 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  52.68 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  51.35 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  52.53 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  52.25 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  52.07 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  52.58 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  48.62 
 
 		 244 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  48.79 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  46.4 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  50 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  46.48 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  55.9 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  37.4 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  43.48 
 
 		 208 aa  148  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  44.51 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  39.21 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  37.78 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  76.06 
 
 		 74 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  41.18 
 
 		 151 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  28.64 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  30.37 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  27.94 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  29.06 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  28.05 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  31.09 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  83.33 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  30.73 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  30.18 
 
 		 266 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  30.18 
 
 		 266 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  28.16 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  25.87 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  27.96 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  27.98 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  29.29 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  53.03 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  28.37 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  25.52 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  28.91 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  27.17 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  25 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  27.68 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  29.74 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  23.63 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  26.44 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  29.69 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  31.03 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  30.05 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  24.87 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  28.5 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  27.72 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  26.34 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  30.52 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  26.8 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  25.12 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  34.29 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  28.79 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  24.73 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  28.04 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  26.98 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  26.77 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  26.76 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  27.91 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  28.04 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  25.6 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0838  hypothetical protein  53.33 
 
 		 129 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  25.37 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1998  hypothetical protein  54.55 
 
 		 77 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  26.82 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  25.12 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  25.99 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  27.51 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  25.39 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  24.88 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  26.98 
 
 		 255 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  22.32 
 
 		 259 aa  48.1  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  27.88 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04880  hypothetical protein  28.92 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  27.39 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  24.34 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  26.56 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  24.64 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  24.11 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  27.61 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  31.4 
 
 		 346 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  26.17 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  25.89 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  24.74 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  25.5 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1551  protein of unknown function DUF159  32.88 
 
 		 258 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0992681  normal  0.026854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  27.15 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>