164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3101 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  100 
 
 		 197 aa  409  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  90.86 
 
 		 197 aa  377  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  65.99 
 
 		 199 aa  277  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  63.27 
 
 		 198 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  41.71 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  38.69 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  41.21 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  33.84 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2283  hypothetical protein  38.12 
 
 		 168 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  37.8 
 
 		 165 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  32.6 
 
 		 216 aa  72  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  30.04 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  27.62 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  28.08 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  34.65 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  33.52 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  32.97 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  29.56 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  32.2 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  36.67 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  35.19 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  30.88 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  29.69 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  31.94 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  35.09 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  29.3 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  31.65 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  31.17 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  29.38 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  32.48 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  32.29 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  31.63 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  29.89 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2523  hypothetical protein  30.77 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  28.79 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  27.85 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  34.03 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  32.56 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  31.79 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  27.22 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  26.95 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  28.26 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  29.82 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  32.63 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04880  hypothetical protein  28.87 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  36.67 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  27.93 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  29.44 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  33.64 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  31.97 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  29.37 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  28.96 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  27.65 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30.37 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  29.73 
 
 		 346 aa  54.7  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  32.02 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  32.87 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  30.66 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  33.13 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  25.76 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  31.62 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  29.1 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  33.04 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  31.3 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1551  protein of unknown function DUF159  28.77 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0992681  normal  0.026854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  26.84 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  29.09 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0200  hypothetical protein  29.29 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.189466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  26.03 
 
 		 268 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  29.06 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  24.26 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  28.35 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  25.68 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  27.37 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  29.61 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  26.76 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  30.7 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  33.07 
 
 		 281 aa  52.4  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  31.19 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  29.19 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  29.25 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  30.17 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  29.08 
 
 		 259 aa  52  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  32.11 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  26.76 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  23.6 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  25.18 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  25.18 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  30.43 
 
 		 247 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  25.18 
 
 		 222 aa  51.2  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  26.62 
 
 		 247 aa  51.2  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3992  hypothetical protein  33.65 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  33.73 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  30.33 
 
 		 262 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  27.37 
 
 		 260 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  33.03 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  31.25 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>