164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4873 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  54.22 
 
 		 228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  45.41 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  39.3 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  40.8 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  38.97 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  39.69 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  37.39 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  38.56 
 
 		 234 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  36.32 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  37.68 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  36.18 
 
 		 215 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  39.77 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  34.47 
 
 		 207 aa  98.6  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4717  protein of unknown function DUF159  38.78 
 
 		 167 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.143313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  28.95 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  35.12 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  31.5 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  32.12 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  31.82 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1281  gp33  53.97 
 
 		 64 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1498  hypothetical protein  51.56 
 
 		 84 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198393  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  28.14 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  30.97 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  28 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  31.82 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  34 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  30.63 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  35.43 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  31.89 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  31.13 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  28.77 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  32.5 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  31.21 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  32.98 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1045  hypothetical protein  48.15 
 
 		 126 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024831  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  32.27 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  27.56 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  32.09 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  25.91 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  25.91 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  32.14 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  25.4 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  29.61 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  28.81 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  26.83 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  29.07 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  27.63 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  26.54 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  30.26 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  29.71 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  30.28 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  32.48 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  27.03 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  32.99 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  31.65 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  41.33 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  29.89 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  28.09 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  30.18 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  27.66 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  33.13 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  32.43 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  27.78 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  29.17 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  31.11 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  29.03 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  27.63 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  29.14 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  34.68 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  33.97 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  34.48 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  30.81 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  32.53 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  28.88 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  26.32 
 
 		 212 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  29.63 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  35.11 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  30.54 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  31.9 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  30.06 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  28.49 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  26.32 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  27.19 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  33.1 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  28.06 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  30.34 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  33.12 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  24.9 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  33.1 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  28.48 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  28.48 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  29.63 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  31.51 
 
 		 224 aa  49.3  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3704  protein of unknown function DUF159  28.67 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  28.28 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  29.61 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>