39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1843 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  80.26 
 
 		 238 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  65.24 
 
 		 233 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  58.33 
 
 		 189 aa  231  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  48.93 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  45.73 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  45.3 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  37.87 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  38.56 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  36.6 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1498  hypothetical protein  71.79 
 
 		 84 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1281  gp33  82.81 
 
 		 64 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307097  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  40.6 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  33.8 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  35.33 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1045  hypothetical protein  79.25 
 
 		 126 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024831  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  39.37 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  30.13 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  36.43 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  31.21 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4717  protein of unknown function DUF159  30.67 
 
 		 167 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.143313 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  30.57 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2378  hypothetical protein  70 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1766  hypothetical protein  70 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  30.69 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  26.67 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  26.63 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  27.14 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  29.38 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  29.84 
 
 		 197 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  27.95 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  28.36 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  26.62 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  25.62 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  27.4 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  26.99 
 
 		 238 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>