51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4381 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  84 
 
 
260 aa  400  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  83.11 
 
 
225 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  54.3 
 
 
233 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  48.93 
 
 
234 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  50 
 
 
238 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  50.28 
 
 
189 aa  191  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  39.29 
 
 
227 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  41.09 
 
 
228 aa  134  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  39.3 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  41.07 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  33.77 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  32.91 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  30.97 
 
 
215 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  38.2 
 
 
207 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  46.46 
 
 
179 aa  101  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  34.16 
 
 
214 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4717  protein of unknown function DUF159  40 
 
 
167 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.143313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  34.63 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1498  hypothetical protein  50.65 
 
 
84 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1281  gp33  58.73 
 
 
64 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  33.56 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1045  hypothetical protein  57.41 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024831  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  31.54 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  26.84 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  28.99 
 
 
233 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  26.84 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  28.86 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  27.66 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  28.02 
 
 
240 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 
247 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  32.09 
 
 
227 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  25.93 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  23.39 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  27.01 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  31.87 
 
 
212 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  32.37 
 
 
232 aa  48.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  33.7 
 
 
212 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  23.6 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  26.95 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  31.52 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  23.98 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3372  hypothetical protein  25.38 
 
 
224 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  28.21 
 
 
217 aa  45.4  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  30.43 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  32.61 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  34.78 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  30 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  29.82 
 
 
223 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  31.88 
 
 
234 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  27.41 
 
 
252 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>