23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1281 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1281  gp33  100 
 
 
64 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  98.41 
 
 
233 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1498  hypothetical protein  92.19 
 
 
84 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  82.81 
 
 
234 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  80.95 
 
 
238 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1045  hypothetical protein  78.85 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024831  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  58.73 
 
 
225 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  56.25 
 
 
260 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  54.69 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  53.97 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  46.03 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  54.1 
 
 
228 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  47.46 
 
 
215 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  54.35 
 
 
265 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1766  hypothetical protein  71.05 
 
 
73 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2378  hypothetical protein  71.05 
 
 
73 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  52.27 
 
 
179 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  41.94 
 
 
214 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  47.06 
 
 
207 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  41.67 
 
 
232 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  33.87 
 
 
246 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  36.36 
 
 
245 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  40.58 
 
 
224 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.542983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>