69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1128 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  97.33 
 
 		 260 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  83.11 
 
 		 225 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  55.36 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  45.73 
 
 		 238 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  45.73 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  53.3 
 
 		 189 aa  201  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  40.99 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  41.58 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  38.97 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  37.84 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  40.72 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  44.83 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  33.47 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  39.55 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  34.98 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  31.67 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4717  protein of unknown function DUF159  37.78 
 
 		 167 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.143313 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1498  hypothetical protein  51.28 
 
 		 84 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1281  gp33  54.69 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  28.32 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1045  hypothetical protein  52.83 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024831  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  28.48 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  30 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  27.89 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  29.61 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  29.44 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  30.51 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  25.69 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  26.29 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  29.61 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  27.66 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  32.81 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  27.37 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  30.99 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  31.65 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  27.46 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  28.66 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  26.79 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  27.27 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  29.93 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  24.86 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  28.65 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  30.58 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  26.09 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  31.52 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  30.66 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  24.29 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  24.29 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  28.26 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  22.95 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  23.35 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  29.63 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  29.19 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  30.19 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  29.41 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3372  hypothetical protein  23.74 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  27.05 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  27.94 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  32.41 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  30.47 
 
 		 259 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  29.29 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  33.58 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  30.71 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  29.05 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  26.12 
 
 		 224 aa  42  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  25.74 
 
 		 235 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  26.79 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>