187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4344 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  60.28 
 
 		 214 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  40.64 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  43.37 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  38.46 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  48.48 
 
 		 227 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  40.23 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  36.71 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  36.18 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  31.58 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  30.7 
 
 		 260 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  38.85 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  30.97 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  32.29 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  35.47 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  32.81 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  34.93 
 
 		 238 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  32.41 
 
 		 252 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  33.67 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  33.8 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  35.9 
 
 		 221 aa  95.5  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  38.41 
 
 		 179 aa  94.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  36.08 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  36.7 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  36.14 
 
 		 238 aa  92  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  40.31 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  41.09 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  33.85 
 
 		 221 aa  91.3  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  33 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  37.06 
 
 		 245 aa  88.6  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  33.57 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  30.4 
 
 		 253 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  31.82 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  34.36 
 
 		 243 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  33.49 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  31.44 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  38.81 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  32.51 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  31.38 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  31.41 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  32.67 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  33.11 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  32.56 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  29.23 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  31.34 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  35 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  28.77 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  32.95 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  36.31 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  31.09 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  28.65 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  28.72 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  31.79 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  31.06 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  30.77 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  29.78 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  35.1 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  31.68 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  39.53 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  34.82 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  28.72 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  33 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  29.21 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  29.65 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  35.66 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  36.6 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  31.82 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  34.51 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  33.58 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  32.68 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  33.57 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  39.46 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  28.07 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  27.23 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  30.81 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  28.16 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  30 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  30.92 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  41.24 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  30.5 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  32.03 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  27.6 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  31.91 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  27.4 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  28.64 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  35.62 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  26.67 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  25.93 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  30.46 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  27.94 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  29.22 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  28.76 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  30.67 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  27.08 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  28.35 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  28.79 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  35.85 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  33.56 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  26.39 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>