189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1661 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  60.28 
 
 		 215 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  43.72 
 
 		 246 aa  188  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  42.86 
 
 		 265 aa  167  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  43.08 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  35.35 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  41.71 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  36.32 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  36.36 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  37.24 
 
 		 233 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  35.19 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  44.09 
 
 		 179 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  30.88 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  34.16 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  29.67 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  34.1 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  37.65 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  38.16 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  40.37 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  40.91 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  34.92 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  31.67 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  36.49 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  33.85 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  41.98 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  35.29 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  35.33 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  31.84 
 
 		 247 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  35.62 
 
 		 227 aa  91.3  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  39.53 
 
 		 218 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  35.76 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  32.13 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  34.27 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  31.82 
 
 		 236 aa  88.2  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  37.09 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  37.04 
 
 		 245 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  31.08 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  34.64 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  34.59 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  39.53 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  32.84 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  33.13 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  31.77 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  29.61 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 290 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  34.25 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  34.25 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  30.48 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  30.74 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  32.72 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  29.17 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  39.85 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  32.26 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  36.15 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  39.05 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  26.82 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  37.21 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  31 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  32.68 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  35.38 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  36.62 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  30.09 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  30.84 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  31.06 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  34.29 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  35.38 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  30.8 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  37.58 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  27.83 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  36.36 
 
 		 257 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  34.88 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  31.79 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  32.18 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  33.73 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  35.38 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  35.8 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  32.89 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  31.68 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  31.06 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  33.08 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  30.82 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  30.82 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  36.84 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  30.09 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  31 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  32.9 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  35.56 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  31.58 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  30.29 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  33.95 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  31.06 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  33.08 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  27.32 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  29.59 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  36.96 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  28.79 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  41.57 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  29.22 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  34.78 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>