103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4073 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  88.76 
 
 		 232 aa  315  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  48.63 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  50 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  44.3 
 
 		 224 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  42.76 
 
 		 265 aa  114  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  46.43 
 
 		 260 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  44.83 
 
 		 225 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  44.09 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  46.46 
 
 		 225 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  42.28 
 
 		 233 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  38.41 
 
 		 215 aa  94.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  37.75 
 
 		 247 aa  92  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  40 
 
 		 237 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  35.2 
 
 		 246 aa  85.5  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  34.04 
 
 		 227 aa  84.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  38.81 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  37.5 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  39.37 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  34.92 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  38.52 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  39.18 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  39.05 
 
 		 252 aa  67.8  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  34.23 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  29.93 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  36.62 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  35.07 
 
 		 226 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  32.56 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1498  hypothetical protein  54.55 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1281  gp33  52.27 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307097  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  34.31 
 
 		 257 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  30.14 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  34.09 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  31.43 
 
 		 274 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  34.92 
 
 		 220 aa  52  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  51.6  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  31.82 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  35.82 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  35.43 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  34.35 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  28.46 
 
 		 240 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  40.23 
 
 		 250 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  28.68 
 
 		 235 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  32.09 
 
 		 244 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  32.56 
 
 		 223 aa  47.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  30.67 
 
 		 223 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  31.48 
 
 		 222 aa  47.8  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  33.8 
 
 		 252 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  40 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  35.4 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  32.12 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  33.59 
 
 		 254 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  34.9 
 
 		 251 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  36.14 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  34.65 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  29.53 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  32.03 
 
 		 252 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  33.59 
 
 		 239 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  32.77 
 
 		 261 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3372  hypothetical protein  32.58 
 
 		 224 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  31.11 
 
 		 259 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  34.25 
 
 		 216 aa  44.7  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  30 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  44.7  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  36.36 
 
 		 240 aa  44.7  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 234 aa  44.7  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  27.16 
 
 		 254 aa  44.7  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  37.08 
 
 		 233 aa  44.3  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1045  hypothetical protein  38.78 
 
 		 126 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024831  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  31.4 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  29.68 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  32.43 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  32.82 
 
 		 270 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  28.38 
 
 		 248 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3039  hypothetical protein  27.42 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  28.89 
 
 		 268 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  31.48 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0315  hypothetical protein  29.01 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  32.31 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  26.92 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  31.43 
 
 		 268 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3992  hypothetical protein  28.28 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1211  protein of unknown function DUF159  32.68 
 
 		 265 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.074414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  27.07 
 
 		 234 aa  42  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  30.91 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  33.93 
 
 		 218 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  34.96 
 
 		 346 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  33.73 
 
 		 221 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  29.46 
 
 		 224 aa  42  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  29.25 
 
 		 266 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  29.25 
 
 		 266 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  30.12 
 
 		 232 aa  41.2  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  33.58 
 
 		 255 aa  41.2  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  29.5 
 
 		 256 aa  41.6  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  30.6 
 
 		 236 aa  41.2  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  27.96 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  32.84 
 
 		 243 aa  41.2  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  34.88 
 
 		 221 aa  41.2  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>