150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1211 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1211  protein of unknown function DUF159  100 
 
 		 265 aa  488  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.074414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  39.42 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  40.19 
 
 		 253 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  38.52 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  39.18 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  36.64 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  38.43 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  39.91 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  41.91 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  39.2 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  39.56 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  44.03 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  32.79 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  38.6 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  41.1 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  36.71 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  35.54 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  41.53 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  39.08 
 
 		 261 aa  111  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  34.43 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  37.05 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  43.62 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  41.14 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  36.07 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  34.85 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  29.54 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  32.08 
 
 		 338 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  36.29 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3704  protein of unknown function DUF159  34.96 
 
 		 283 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  28.02 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  28.7 
 
 		 235 aa  89  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  34.57 
 
 		 242 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  28.5 
 
 		 222 aa  87  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  32.59 
 
 		 290 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  39.24 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  34.88 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  33.85 
 
 		 221 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  31.74 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  31.39 
 
 		 226 aa  85.5  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  31.61 
 
 		 222 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  29.07 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  32.94 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  30.14 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  28.49 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  29.3 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  31.72 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  28.8 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  34.15 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  32.69 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  33.12 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  35.37 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  32.92 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  32.91 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  30.82 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  33.92 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  34.88 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  30.05 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  32.58 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  32.58 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  32.53 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  33.81 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  33.19 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  34.62 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  33.81 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  32.47 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  30.45 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  30.81 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  32.19 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  31.62 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  28.07 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  24.42 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  28.4 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  24.1 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  24.1 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  23.69 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  30.19 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  34.53 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  22.62 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  28.9 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  27.27 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  34.44 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  38.64 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  26.97 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  33.16 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  25.85 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  27.89 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  25.9 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  30.53 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  30.77 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  31.05 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  28.97 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  42.39 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  30.49 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  30.81 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  27.21 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  32.09 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>