136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2224 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  41.67 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  41.85 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  39.47 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  41.71 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  35.51 
 
 		 265 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  44.3 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  40.23 
 
 		 215 aa  121  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  32.91 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  33.47 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  33.47 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  34.5 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  30.39 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  36.73 
 
 		 227 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  32.03 
 
 		 233 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  32.2 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  28.95 
 
 		 237 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  35.03 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  41.03 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  31.02 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  30.12 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  30 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  31.7 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  33.71 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  35.71 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  28.74 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  32.24 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  29.81 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  32.48 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  31.87 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  28.17 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  37.84 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  30.64 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  33.06 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  31.28 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  35.09 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  29.59 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  37.23 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  29.19 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  32.03 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  30.77 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  29.94 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  34.38 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  31.71 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  29.44 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  37.5 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  32.2 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  32.02 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  31.1 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  26.94 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  29.7 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  29.11 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4717  protein of unknown function DUF159  28.36 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.143313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  32.56 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  39.18 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  31.36 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  32.17 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  27.16 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  36.59 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  28.72 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  31.72 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  30.64 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  29.41 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  35.45 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  29.82 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  31.1 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  34.62 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  38.18 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  27.59 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  36.07 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  25.93 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  30.28 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  29.35 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  30 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  26.26 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  34.71 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  31.11 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  31.43 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  31.72 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  29.1 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  27.57 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  25 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  31.03 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  28.57 
 
 		 259 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  25.68 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  26.15 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  36.08 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  31.4 
 
 		 338 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  30.84 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  27.66 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  27.66 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  32.67 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  31.63 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  28.76 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  27.74 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  29.29 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  29.01 
 
 		 256 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  28.19 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  27.54 
 
 		 254 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>