44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4717 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4717  protein of unknown function DUF159  100 
 
 
167 aa  347  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.143313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  37.74 
 
 
225 aa  97.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  38.46 
 
 
237 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  39.06 
 
 
227 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  35.85 
 
 
225 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  35.22 
 
 
260 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  32.42 
 
 
233 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  34.75 
 
 
189 aa  87.8  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  38.66 
 
 
228 aa  87.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  33.82 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  43.21 
 
 
265 aa  68.2  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  31.06 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  30.67 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  27.63 
 
 
238 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  38.27 
 
 
214 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  28.36 
 
 
224 aa  58.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  32.8 
 
 
240 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  31.53 
 
 
246 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 
238 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  33.65 
 
 
239 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  32.69 
 
 
242 aa  50.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  32.95 
 
 
252 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  32.71 
 
 
222 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  30.51 
 
 
212 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  30.51 
 
 
212 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  29.73 
 
 
222 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  27.12 
 
 
212 aa  48.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  25.42 
 
 
212 aa  47.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  32.94 
 
 
236 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  27.36 
 
 
212 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41280  hypothetical protein  26.67 
 
 
205 aa  44.3  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  36.11 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  27.82 
 
 
231 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  26.96 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 
234 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  28.24 
 
 
232 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  24.3 
 
 
212 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  37.14 
 
 
222 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  30.67 
 
 
233 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  25.9 
 
 
254 aa  42.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  24.56 
 
 
215 aa  41.6  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  30.93 
 
 
237 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  30.95 
 
 
179 aa  40.8  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  31.13 
 
 
197 aa  40.8  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>