152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2783 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  100 
 
 		 197 aa  410  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  90.86 
 
 		 197 aa  377  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  67.01 
 
 		 199 aa  279  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  62.76 
 
 		 198 aa  264  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  40.2 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  38.19 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  40.2 
 
 		 196 aa  121  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  33.67 
 
 		 236 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2283  hypothetical protein  38.41 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  40.41 
 
 		 165 aa  88.2  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  35.34 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  28.75 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  29.18 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  31.49 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  27.69 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  31.89 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  32.95 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  29.71 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  30.59 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  34.69 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  26.67 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0200  hypothetical protein  29.45 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.189466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  30.37 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  31.48 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  29.93 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  30.95 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  28.5 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04880  hypothetical protein  28.87 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  26.11 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  30.89 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  32.89 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  27.89 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  30.83 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  30.22 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  26.84 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  32.74 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  27.93 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  35.54 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  30.77 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  26.24 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  31.9 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  31.62 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  28.03 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  27.34 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  29.86 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  30.6 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  32.48 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  32.46 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1551  protein of unknown function DUF159  28.08 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0992681  normal  0.026854 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  32.53 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  30.7 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  31.67 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  30 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2523  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  28.05 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  30.53 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  31.4 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  28.44 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  27.01 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  30.43 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  31.72 
 
 		 261 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  30.99 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  30.21 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  29.06 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  27.86 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  26.62 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  26.62 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  32.09 
 
 		 346 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  33.68 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  32.14 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  34.52 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  29.29 
 
 		 231 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  29.23 
 
 		 268 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  25.68 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  32.29 
 
 		 232 aa  51.6  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  32.73 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  30 
 
 		 233 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  35.83 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  26.74 
 
 		 247 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  35.65 
 
 		 337 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  29.82 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3992  hypothetical protein  32.61 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  27.08 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  32.17 
 
 		 338 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  29.2 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  27.27 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  28.22 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  31.5 
 
 		 281 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  36.17 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  27.78 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  33.03 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  24.65 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  30 
 
 		 262 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  23.85 
 
 		 237 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  25.28 
 
 		 226 aa  48.5  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  28.87 
 
 		 242 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  28.36 
 
 		 238 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  31.88 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>