91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4810 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  194  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3985  hypothetical protein  95.08 
 
 
91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1346  hypothetical protein  95.08 
 
 
91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.439397  hitchhiker  0.000296751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0166  hypothetical protein  86.89 
 
 
91 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0084  hypothetical protein  86.89 
 
 
91 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2948  hypothetical protein  80.95 
 
 
93 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1049  hypothetical protein  73.33 
 
 
90 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7962  hypothetical protein  73.02 
 
 
90 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.027631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5542  hypothetical protein  71.43 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2963  hypothetical protein  73.33 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0077  hypothetical protein  87.76 
 
 
93 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932951  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  87.5 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4248  hypothetical protein  69.81 
 
 
93 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287019  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2497  hypothetical protein  69.81 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.514422  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  67.86 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  84.62 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  66.07 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  82.05 
 
 
74 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  79.49 
 
 
244 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  79.49 
 
 
244 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  79.49 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  83.33 
 
 
220 aa  63.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  70 
 
 
244 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  71.79 
 
 
257 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2034  hypothetical protein  51.11 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.492763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4670  hypothetical protein  46.67 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  64.1 
 
 
222 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  69.23 
 
 
241 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6866  hypothetical protein  46 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  0.022304 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  62.5 
 
 
177 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1221  hypothetical protein  46.67 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.661908  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1405  hypothetical protein  46.67 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479596  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2977  hypothetical protein  51.11 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734498  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2750  hypothetical protein  51.11 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.897901  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3979  hypothetical protein  46.67 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121303  normal  0.274015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2872  hypothetical protein  51.11 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1426  hypothetical protein  46.67 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0989  hypothetical protein  46.67 
 
 
89 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.684189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0123  hypothetical protein  46 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3184  hypothetical protein  53.33 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34429  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0876  hypothetical protein  43.14 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271927  normal  0.154424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  51.85 
 
 
246 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3694  hypothetical protein  50 
 
 
98 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1620  hypothetical protein  48.89 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  59.09 
 
 
232 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  59.09 
 
 
215 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  50 
 
 
229 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2443  hypothetical protein  40.35 
 
 
175 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  59.09 
 
 
222 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  69.23 
 
 
226 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  62.5 
 
 
256 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0180  hypothetical protein  51.11 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3737  hypothetical protein  47.06 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00728994  normal  0.292015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2066  hypothetical protein  48.89 
 
 
87 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576605  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  59.09 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  62.86 
 
 
208 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2680  hypothetical protein  44.44 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212729  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5968  hypothetical protein  42.22 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5200  hypothetical protein  42.22 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2535  hypothetical protein  40.74 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1740  hypothetical protein  42.31 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1502  hypothetical protein  48 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  56.82 
 
 
215 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0915  hypothetical protein  42 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3227  hypothetical protein  39.13 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1313  hypothetical protein  47.83 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.214688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1696  hypothetical protein  44 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000802562  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3699  hypothetical protein  41.3 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1480  hypothetical protein  37.97 
 
 
84 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0557  hypothetical protein  43.14 
 
 
88 aa  47  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1419  hypothetical protein  43.14 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.500406  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1734  hypothetical protein  35.29 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1798  hypothetical protein  45.1 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.320432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0164  hypothetical protein  45.1 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3293  hypothetical protein  44.44 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.587635  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3594  hypothetical protein  44.44 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1161  hypothetical protein  42.22 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178544  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2635  hypothetical protein  41.18 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1691  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3367  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  50 
 
 
214 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0462  hypothetical protein  39.22 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.781265  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1557  hypothetical protein  39.58 
 
 
206 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3695  hypothetical protein  42.22 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0576  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  42  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.191205  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1752  hypothetical protein  37.78 
 
 
86 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0130  hypothetical protein  37.78 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3610  hypothetical protein  45.65 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2078  hypothetical protein  45.65 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  55.56 
 
 
210 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0430  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>