80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1134 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  100 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  85.17 
 
 		 246 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  75 
 
 		 241 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  69.58 
 
 		 244 aa  345  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  66.95 
 
 		 244 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  59.49 
 
 		 215 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  56.67 
 
 		 222 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  54.22 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  54.58 
 
 		 217 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  53.75 
 
 		 217 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  48.05 
 
 		 210 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  51.78 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  49.61 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  49.59 
 
 		 220 aa  211  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  44.44 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  45.49 
 
 		 222 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  46.06 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  45.76 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  44.4 
 
 		 215 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  46.81 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  71.43 
 
 		 151 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  41.98 
 
 		 256 aa  178  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  41.91 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  49.11 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  44.63 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  35.34 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  34.73 
 
 		 223 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  33.62 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  64.62 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  26.09 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  62.96 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  28.11 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  28.36 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  24.79 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  27.64 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  69.23 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  27.73 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  24.38 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  33.66 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  33.09 
 
 		 165 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  28.04 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  27.12 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  23.27 
 
 		 238 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  25.59 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  35.61 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  27.47 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  23.08 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  25.79 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  24.5 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  24.6 
 
 		 196 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  23.04 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  28.97 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  24.09 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  35 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  24.9 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  27.1 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  26.94 
 
 		 198 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1998  hypothetical protein  47.73 
 
 		 77 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  28.18 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  23.67 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  30.83 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  28.82 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0838  hypothetical protein  47.73 
 
 		 129 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  34.17 
 
 		 254 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  30.17 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  29.9 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  24.59 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  31.82 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  29.41 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  31.37 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  32.8 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  26.58 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2283  hypothetical protein  30.43 
 
 		 168 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  34.31 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3873  hypothetical protein  31.58 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  25.41 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  30.36 
 
 		 222 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  22.8 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  22.05 
 
 		 233 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>