77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3873 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3873  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4577  hypothetical protein  69.87 
 
 		 230 aa  346  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3372  hypothetical protein  36.24 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  29.18 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  29.02 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02109  hypothetical protein  28.98 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.277262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  29.94 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  34.58 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  28.85 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  29.85 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  28.89 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  28.8 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  27.23 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  27.23 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  26.21 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  29.02 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  27.67 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  28.42 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  28.22 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  24.88 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  29.89 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  29.44 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  26.47 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  28.85 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  27.23 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  25.11 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  29.31 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0386  hypothetical protein  27.81 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782275  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  26.27 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  24.31 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  28.51 
 
 		 248 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  29.41 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  25.48 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  25.57 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  25.69 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1918  hypothetical protein  26.15 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.78991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  25.42 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  30.16 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  29.19 
 
 		 338 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0315  hypothetical protein  26.24 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0311  hypothetical protein  26.73 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1263  hypothetical protein  27.68 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  23.68 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  23.68 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  24.65 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2605  hypothetical protein  26.15 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  31.86 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  28.43 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  25.71 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  25.71 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  25.5 
 
 		 218 aa  46.2  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  25.9 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  21.72 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  26.98 
 
 		 239 aa  45.1  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  27.41 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  26.13 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0800  hypothetical protein  22.16 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  26.96 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  25.38 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  31.71 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  29.27 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0786  hypothetical protein  21.62 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  29.06 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4430  hypothetical protein  22.83 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  31.03 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  24.17 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0758  hypothetical protein  21.62 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  28.3 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  31.58 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61320  hypothetical protein  24.87 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.681363 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  28.14 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  28.81 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  28.65 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  27.62 
 
 		 247 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04161  DUF159 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13150)  28.7 
 
 		 388 aa  42  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0736847  normal  0.55935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  23.66 
 
 		 224 aa  42  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>