67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3995 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  465  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  62.95 
 
 		 222 aa  280  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  60.48 
 
 		 244 aa  274  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  59.11 
 
 		 244 aa  264  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  59.73 
 
 		 217 aa  250  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  56.68 
 
 		 210 aa  248  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  58.22 
 
 		 215 aa  248  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  54.22 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  58.85 
 
 		 217 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  53.23 
 
 		 241 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  54.03 
 
 		 246 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  51.74 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  50.22 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  51.67 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  50.66 
 
 		 215 aa  202  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  50.65 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  51.6 
 
 		 244 aa  197  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  48.03 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  48.88 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  48.29 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  44.05 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  41.06 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  55.78 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  48.21 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  41.99 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  39.47 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  39.72 
 
 		 208 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  40.65 
 
 		 151 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  52.5 
 
 		 177 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  59.38 
 
 		 74 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  31.08 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  30.8 
 
 		 346 aa  68.6  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  27.4 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  32.56 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  30.53 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  28.83 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  29.82 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  29.03 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  28.19 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  27.63 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  29.55 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  29.95 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  69.23 
 
 		 98 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  26.2 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  25.82 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  28.12 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  25.56 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  28.09 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  29.36 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  28.09 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  27.27 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  30.94 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  32.37 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  30.35 
 
 		 241 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  28.44 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1580  hypothetical protein  35.29 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  27.06 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  28.33 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0838  hypothetical protein  45.1 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  26.27 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  26.82 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  27.6 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  22.62 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  29.48 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  31.05 
 
 		 240 aa  42  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  22.61 
 
 		 242 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  25.45 
 
 		 221 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>