202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4716 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4716  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4430  hypothetical protein  81.16 
 
 		 206 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0786  hypothetical protein  78.26 
 
 		 206 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0758  hypothetical protein  77.78 
 
 		 206 aa  328  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0800  hypothetical protein  78.16 
 
 		 206 aa  328  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1143  hypothetical protein  76.33 
 
 		 209 aa  314  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0983  hypothetical protein  75.36 
 
 		 209 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.015485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41280  hypothetical protein  68.6 
 
 		 205 aa  277  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3670  hypothetical protein  68.6 
 
 		 205 aa  274  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5280  hypothetical protein  69.08 
 
 		 204 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.191722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61320  hypothetical protein  68.12 
 
 		 204 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.681363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  37.22 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  33.48 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  35.75 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  35.45 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  33.88 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  34.22 
 
 		 222 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  35 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  36.04 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  31.98 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  30.32 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  33.94 
 
 		 222 aa  111  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  37.99 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  35 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  34.78 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  34.8 
 
 		 226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  35.87 
 
 		 226 aa  107  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  34.85 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  34.53 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  35.17 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  34.19 
 
 		 244 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  36.82 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  31.97 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  31.82 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  34.23 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  33.04 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  33.18 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  33.18 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  37.22 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  34.81 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  32.39 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  33.63 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  32.74 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  34.81 
 
 		 257 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  34.98 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  31.54 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  35.39 
 
 		 224 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  35.36 
 
 		 259 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  31.25 
 
 		 290 aa  98.6  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  32.26 
 
 		 268 aa  98.6  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  33.18 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  35.91 
 
 		 255 aa  98.2  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3022  hypothetical protein  34.76 
 
 		 223 aa  98.2  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.310509  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  28.88 
 
 		 234 aa  97.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  35.71 
 
 		 241 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  35.2 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  34.81 
 
 		 254 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  31.84 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  33.2 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  31.65 
 
 		 247 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  32.11 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  36.21 
 
 		 248 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  34.02 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  32.43 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  32.77 
 
 		 252 aa  95.9  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  29.25 
 
 		 255 aa  96.3  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  36.76 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  36.22 
 
 		 255 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  36.22 
 
 		 254 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  33.2 
 
 		 254 aa  95.1  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  35.56 
 
 		 239 aa  94.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  31.74 
 
 		 252 aa  94.7  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  31.84 
 
 		 252 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  33.48 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  31.3 
 
 		 281 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  32.62 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  30.8 
 
 		 261 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  33.92 
 
 		 243 aa  92  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  30.8 
 
 		 266 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  31.28 
 
 		 220 aa  92  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  30.8 
 
 		 266 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  30.29 
 
 		 252 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  32.72 
 
 		 248 aa  91.7  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  31.61 
 
 		 221 aa  91.3  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  30.92 
 
 		 253 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  35.9 
 
 		 257 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  27.23 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  32.28 
 
 		 274 aa  89  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  31.44 
 
 		 224 aa  89  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  28.89 
 
 		 231 aa  88.6  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  32.64 
 
 		 252 aa  89  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  26.7 
 
 		 232 aa  88.6  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  30.7 
 
 		 231 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  32.31 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  33.99 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  33.86 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  31.98 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>