196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0983 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0983  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.015485  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1143  hypothetical protein  96.17 
 
 
209 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4716  hypothetical protein  75.36 
 
 
207 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0800  hypothetical protein  72.12 
 
 
206 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0758  hypothetical protein  72.95 
 
 
206 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0786  hypothetical protein  72.95 
 
 
206 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4430  hypothetical protein  72.46 
 
 
206 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3670  hypothetical protein  70.05 
 
 
205 aa  288  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5280  hypothetical protein  69.57 
 
 
204 aa  276  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.191722  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41280  hypothetical protein  68.12 
 
 
205 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61320  hypothetical protein  68.12 
 
 
204 aa  271  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.681363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  36.94 
 
 
233 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  36.44 
 
 
224 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  37.12 
 
 
226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  36.36 
 
 
221 aa  118  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  35.71 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  35.59 
 
 
248 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  34.38 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  31.56 
 
 
238 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  33.19 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  36.67 
 
 
232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  36.84 
 
 
244 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  34.23 
 
 
223 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  32.1 
 
 
253 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  36.52 
 
 
243 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  36.44 
 
 
222 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  32.44 
 
 
226 aa  101  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  32.91 
 
 
233 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  34.91 
 
 
253 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  29.15 
 
 
237 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  33.63 
 
 
222 aa  99.4  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  31.45 
 
 
268 aa  99.8  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  30 
 
 
231 aa  99  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  34.48 
 
 
255 aa  98.2  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  28.51 
 
 
222 aa  97.8  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  29.67 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  32.14 
 
 
239 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  35.33 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  31.6 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  31.28 
 
 
257 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  32.51 
 
 
261 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  33.47 
 
 
250 aa  95.9  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  32.38 
 
 
253 aa  95.5  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  29.96 
 
 
259 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  26.79 
 
 
234 aa  94.7  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  94.7  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  34.35 
 
 
227 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  27.71 
 
 
234 aa  94  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  32.22 
 
 
233 aa  94  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  31.79 
 
 
240 aa  94  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  28.14 
 
 
242 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  34.26 
 
 
254 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  32.89 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  30.67 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3022  hypothetical protein  39.88 
 
 
223 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.310509  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  33.06 
 
 
254 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  28.95 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  32.89 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  30.22 
 
 
225 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  32.9 
 
 
222 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  32.9 
 
 
222 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  29.33 
 
 
235 aa  92.8  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  33.18 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  38.85 
 
 
248 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  30.87 
 
 
252 aa  92.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  31.98 
 
 
251 aa  92  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  32.72 
 
 
255 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  34.81 
 
 
221 aa  91.3  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  32.16 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  36.31 
 
 
259 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  34.33 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  33.04 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  30.67 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  31.36 
 
 
254 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  32.05 
 
 
252 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  29.65 
 
 
224 aa  88.6  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  34.9 
 
 
224 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  33.52 
 
 
241 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  32.06 
 
 
261 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  31.31 
 
 
221 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  25.97 
 
 
239 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  26.7 
 
 
232 aa  86.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  32.24 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  33.03 
 
 
248 aa  86.3  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  29.74 
 
 
256 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  31.49 
 
 
234 aa  85.5  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  31.22 
 
 
219 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  31.69 
 
 
262 aa  85.5  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  29.11 
 
 
268 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  29.24 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  29.89 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  35.33 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  28.63 
 
 
231 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  29.08 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  27.35 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  34 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  32.14 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  30.57 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  38.39 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  27.27 
 
 
223 aa  82  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>