220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2594 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  71.5 
 
 
217 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  70.83 
 
 
216 aa  302  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  71.2 
 
 
237 aa  300  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  70.16 
 
 
221 aa  298  5e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  68.21 
 
 
213 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  70 
 
 
218 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  64.88 
 
 
205 aa  276  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  64.04 
 
 
210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  66.84 
 
 
216 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  65.13 
 
 
210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  64.1 
 
 
206 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  59.5 
 
 
202 aa  254  7e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  58.71 
 
 
202 aa  254  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  58.71 
 
 
202 aa  254  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  64.25 
 
 
213 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  56.84 
 
 
201 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  56.16 
 
 
205 aa  228  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  55.26 
 
 
201 aa  223  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  55.79 
 
 
201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  53.06 
 
 
214 aa  218  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  51.96 
 
 
200 aa  215  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  51.47 
 
 
200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  53.61 
 
 
202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  55.26 
 
 
201 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  51.85 
 
 
192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  49.75 
 
 
219 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  48.17 
 
 
197 aa  185  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  48.69 
 
 
184 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  48.17 
 
 
184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  178  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  48.45 
 
 
190 aa  177  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  45.63 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  46.88 
 
 
195 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  46.39 
 
 
206 aa  168  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  45.32 
 
 
203 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  45.6 
 
 
189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  45.6 
 
 
189 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  45.6 
 
 
189 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  46.07 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  46 
 
 
193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  46.63 
 
 
186 aa  158  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  44.44 
 
 
187 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  44.44 
 
 
187 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  44.44 
 
 
187 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  43.92 
 
 
208 aa  158  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  43.52 
 
 
190 aa  157  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  45.13 
 
 
190 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  43.92 
 
 
191 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  42.19 
 
 
186 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  44.56 
 
 
192 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  45.08 
 
 
192 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  45.08 
 
 
192 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  44.56 
 
 
192 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  45.08 
 
 
192 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  39.52 
 
 
200 aa  156  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  44.21 
 
 
192 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  44.21 
 
 
192 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  44.56 
 
 
192 aa  155  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  44.21 
 
 
207 aa  155  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  44.21 
 
 
192 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  42.93 
 
 
200 aa  156  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  44.21 
 
 
192 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  44.21 
 
 
192 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  44.21 
 
 
192 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  44.21 
 
 
192 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  44.04 
 
 
190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  43.75 
 
 
190 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  44.04 
 
 
190 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 
189 aa  154  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  43.92 
 
 
186 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  42.86 
 
 
187 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2895  protein of unknown function DUF179  45.32 
 
 
194 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0104323  normal  0.0123149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  43.52 
 
 
192 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  42.86 
 
 
192 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  42.49 
 
 
195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  42.71 
 
 
190 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  42.86 
 
 
187 aa  151  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  44.21 
 
 
221 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  44.21 
 
 
192 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  40.51 
 
 
191 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  43.52 
 
 
192 aa  149  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  41.88 
 
 
188 aa  149  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  38.43 
 
 
234 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  41.62 
 
 
199 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  44.97 
 
 
216 aa  149  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  41.75 
 
 
188 aa  148  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  42.33 
 
 
185 aa  148  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  40.41 
 
 
189 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  40.93 
 
 
189 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  44.97 
 
 
201 aa  148  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  43.92 
 
 
190 aa  147  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  43.52 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  40.1 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  37.56 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  46.07 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  41.62 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  41.27 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>