223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3083 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 192 aa  393  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  58.15 
 
 		 192 aa  214  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  57.92 
 
 		 197 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  57.92 
 
 		 184 aa  211  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  57.38 
 
 		 184 aa  210  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  55.74 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  55.68 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  53.23 
 
 		 205 aa  204  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  55.74 
 
 		 219 aa  203  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  53.44 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  53.61 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  52.88 
 
 		 218 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  52.38 
 
 		 237 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  52.38 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  51.31 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  51.85 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  49.03 
 
 		 206 aa  193  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  51.03 
 
 		 221 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  51.32 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  51.05 
 
 		 213 aa  191  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  50.26 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  50.26 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  49.74 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  52.72 
 
 		 195 aa  188  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  49.21 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  49.74 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  49.21 
 
 		 201 aa  184  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  48.63 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  46.97 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  47.59 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  48.15 
 
 		 202 aa  175  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  46.63 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  47.4 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  48.15 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  46.24 
 
 		 193 aa  170  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  50 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  47.83 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  43.75 
 
 		 191 aa  167  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  48.4 
 
 		 190 aa  167  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  47.57 
 
 		 190 aa  167  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  47.09 
 
 		 200 aa  166  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  46.52 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  47.57 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  45.65 
 
 		 192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  43.01 
 
 		 207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  45.65 
 
 		 192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  45.65 
 
 		 192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  45.65 
 
 		 192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  45.65 
 
 		 192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  43.01 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  43.01 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  43.01 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  43.01 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  43.01 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  43.01 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  43.01 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  45.26 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  44.27 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  44.86 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  44.26 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  45.41 
 
 		 221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  47.34 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  45.41 
 
 		 192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  46.81 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2895  protein of unknown function DUF179  45.95 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0104323  normal  0.0123149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  44.26 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  44.81 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  44.2 
 
 		 188 aa  158  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0683  hypothetical protein  44.26 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0165  hypothetical protein  44.51 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.197287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  43.55 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  41.3 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  41.8 
 
 		 189 aa  154  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  42.86 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  41.62 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  43.09 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  43.98 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  43.98 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  41.85 
 
 		 203 aa  151  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  43.48 
 
 		 189 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  42.02 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  42 
 
 		 199 aa  151  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  41.5 
 
 		 199 aa  150  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  41.3 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  42.93 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  41.3 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  43.39 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  42.25 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  41.3 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  41.08 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  42.25 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  41.71 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  41.71 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  41.71 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  40.76 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  40.11 
 
 		 197 aa  148  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  41.58 
 
 		 196 aa  148  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  41.18 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  41.18 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  41.18 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>