216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2673 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0683  hypothetical protein  59.68 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0165  hypothetical protein  57.61 
 
 		 214 aa  214  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.197287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  48.4 
 
 		 192 aa  180  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  48.63 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  49.18 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  46.45 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  44.72 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  43.88 
 
 		 202 aa  164  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  47.64 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  43.48 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  42.93 
 
 		 184 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  42.56 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  42.56 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  45.26 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  42.93 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  45.55 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  44.97 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  44.33 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  43.92 
 
 		 201 aa  157  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  43.39 
 
 		 210 aa  156  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  43.01 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  44.62 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  45.05 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  43.92 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  41.71 
 
 		 193 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  42.25 
 
 		 193 aa  151  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  44.92 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  43.46 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  41.8 
 
 		 202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  45.7 
 
 		 199 aa  150  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  43.39 
 
 		 221 aa  150  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  43.92 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  41.4 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  40.33 
 
 		 188 aa  148  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  41.71 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  41.18 
 
 		 190 aa  147  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  42.86 
 
 		 237 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  42.7 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  41.18 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  43.39 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  41.4 
 
 		 187 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  39.78 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  39.78 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  39.78 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  41.76 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  40.32 
 
 		 187 aa  141  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  39.89 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  42.02 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  39.25 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  39.36 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  39.25 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  39.25 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  39.25 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  43.78 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  42.02 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  40.22 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2895  protein of unknown function DUF179  45.21 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0104323  normal  0.0123149 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  41.53 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  39.67 
 
 		 191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  40.64 
 
 		 186 aa  138  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  42.08 
 
 		 192 aa  137  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  39.04 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  38.25 
 
 		 184 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  41.21 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  37.23 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  41.21 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  40.32 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  38.38 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  36.02 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  36.02 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  40.54 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  40.54 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  38.92 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  38.92 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  39.04 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  39.04 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  38.92 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  38.92 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  38.92 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  38.92 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  38.92 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  39.46 
 
 		 192 aa  134  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  38.5 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  41.08 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  40.76 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  37.84 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  37.5 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  39.04 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  37.88 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  36.49 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  38.92 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  38.92 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  38.92 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  35.48 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  38.92 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  36.56 
 
 		 187 aa  131  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  37.57 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  38.92 
 
 		 221 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  36.22 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>