222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1574 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  48.07 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  45.9 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  45.95 
 
 		 216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  45.11 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  46.77 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  44.86 
 
 		 191 aa  160  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  45.6 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  44.97 
 
 		 207 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  42.86 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  42.86 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  154  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  154  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  40.78 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  44.39 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  42.16 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  45.6 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  43.24 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  42.86 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  42.86 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  43.92 
 
 		 221 aa  148  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  43.92 
 
 		 192 aa  148  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  43.78 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  41.49 
 
 		 187 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  41.49 
 
 		 187 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  41.49 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  40.96 
 
 		 187 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  40.57 
 
 		 187 aa  147  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  40.96 
 
 		 187 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  40.43 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  43.32 
 
 		 190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  40.43 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  43.32 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  43.39 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  42.7 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  43.48 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  41.49 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  43.09 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  44.75 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  44.75 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  41.49 
 
 		 212 aa  144  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  40.11 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  38.1 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  43.24 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  44.51 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  39.68 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  41.08 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0683  hypothetical protein  42.62 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  41.85 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  40.34 
 
 		 187 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  41.08 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  40.34 
 
 		 187 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  42.86 
 
 		 213 aa  141  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  40.34 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  40.54 
 
 		 184 aa  141  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  42.93 
 
 		 189 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  41.05 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  37.57 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  42.22 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  40.76 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  39.43 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  40.76 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  41.08 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  41.08 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  37.32 
 
 		 234 aa  138  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  42.13 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  41.49 
 
 		 190 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  37.57 
 
 		 187 aa  137  6e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  44.07 
 
 		 173 aa  138  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  46.75 
 
 		 189 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  39.57 
 
 		 201 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  41.27 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  41.08 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  41.04 
 
 		 189 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  41.42 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  42.54 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  38.3 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  43.27 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  40.53 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  43.27 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>