221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5311 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  80.53 
 
 		 189 aa  310  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  74.21 
 
 		 190 aa  298  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  72.63 
 
 		 190 aa  296  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  76.84 
 
 		 189 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  76.32 
 
 		 189 aa  294  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  73.68 
 
 		 189 aa  294  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  76.32 
 
 		 189 aa  294  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  73.68 
 
 		 189 aa  293  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  72.63 
 
 		 201 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  68.39 
 
 		 173 aa  235  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  47.57 
 
 		 216 aa  192  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  51.1 
 
 		 192 aa  189  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  51.37 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  50 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  52.2 
 
 		 186 aa  187  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  47.85 
 
 		 190 aa  186  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  47.83 
 
 		 191 aa  186  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  50 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  47.85 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  47.31 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  48.92 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  48.92 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  47.85 
 
 		 192 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  47.85 
 
 		 192 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  47.85 
 
 		 192 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  47.85 
 
 		 192 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  47.85 
 
 		 192 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  49.47 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  45.74 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  46.6 
 
 		 193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  48.42 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  43.78 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  47.87 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  48.11 
 
 		 191 aa  181  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  46.15 
 
 		 188 aa  178  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  44.81 
 
 		 187 aa  177  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  46.7 
 
 		 190 aa  175  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  45.83 
 
 		 210 aa  175  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  47.25 
 
 		 192 aa  174  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  46.7 
 
 		 190 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  46.15 
 
 		 188 aa  174  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  43.52 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  46.77 
 
 		 193 aa  173  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  44.32 
 
 		 187 aa  171  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  45.03 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  43.15 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  44.86 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  43.78 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  43.32 
 
 		 195 aa  168  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  45.95 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  46.03 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  43.09 
 
 		 188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  42.7 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  43.96 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  46.28 
 
 		 187 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  46.28 
 
 		 187 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  46.28 
 
 		 187 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  44.33 
 
 		 189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  44.21 
 
 		 210 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  42.19 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  45.16 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  45.65 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  45.16 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  45.65 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  42.7 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  42.7 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  42.7 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  42.16 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  42.7 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  42.7 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  43.09 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  45.16 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  42.7 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  42.7 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  42.7 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  42.7 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  41.18 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  40.43 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  40.61 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  40.61 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  42.13 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  45.11 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  41.15 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  42.16 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  39.34 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  41.18 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  41.18 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 189 aa  158  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  42.47 
 
 		 188 aa  157  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  42.7 
 
 		 187 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>