221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0659 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  96.52 
 
 
201 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  71.64 
 
 
201 aa  310  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  71.14 
 
 
201 aa  308  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  57.44 
 
 
200 aa  243  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  56.92 
 
 
200 aa  239  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  57.51 
 
 
216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  53.73 
 
 
214 aa  237  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  56.99 
 
 
221 aa  236  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  57.75 
 
 
202 aa  234  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  56.02 
 
 
210 aa  228  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  56.84 
 
 
205 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  55.1 
 
 
210 aa  227  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  54.74 
 
 
206 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  54.17 
 
 
213 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  52.45 
 
 
205 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  54.21 
 
 
217 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  53.68 
 
 
218 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  52.63 
 
 
237 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  53.68 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  50 
 
 
202 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  50 
 
 
202 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  49.74 
 
 
202 aa  211  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  50.79 
 
 
216 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  47.69 
 
 
205 aa  191  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  46.39 
 
 
219 aa  185  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  47.59 
 
 
192 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  45.45 
 
 
186 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  46.74 
 
 
186 aa  168  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  43.39 
 
 
191 aa  168  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  42.02 
 
 
189 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  44.57 
 
 
216 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  44.74 
 
 
192 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  42.02 
 
 
189 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  42.02 
 
 
189 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  42.55 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  41.49 
 
 
189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  43.48 
 
 
192 aa  165  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  42.78 
 
 
195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  41.49 
 
 
190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  43.48 
 
 
203 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  40.43 
 
 
190 aa  161  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  39.2 
 
 
207 aa  161  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  41.49 
 
 
189 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  41.4 
 
 
192 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  41.4 
 
 
192 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  41.4 
 
 
192 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  41.4 
 
 
192 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  41.4 
 
 
192 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  41.4 
 
 
192 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  41.4 
 
 
192 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  42.78 
 
 
199 aa  160  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  41.49 
 
 
190 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  42.05 
 
 
200 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  45.5 
 
 
184 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  41.85 
 
 
190 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  44.97 
 
 
184 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  40.2 
 
 
221 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  42.86 
 
 
195 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  44.97 
 
 
197 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  39.89 
 
 
189 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  40.67 
 
 
213 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  46.7 
 
 
199 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  41.94 
 
 
192 aa  158  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  40.86 
 
 
192 aa  158  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  40.86 
 
 
192 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  40.86 
 
 
192 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  40.86 
 
 
192 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  40.86 
 
 
192 aa  157  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  40.86 
 
 
192 aa  157  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  43.48 
 
 
190 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  38.58 
 
 
191 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  41.03 
 
 
199 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  41.03 
 
 
199 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  43.08 
 
 
199 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  43.48 
 
 
190 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  38.97 
 
 
200 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  40.32 
 
 
192 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  40.32 
 
 
188 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  43.39 
 
 
190 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  42.47 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  41.3 
 
 
201 aa  154  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  40.43 
 
 
193 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  41.85 
 
 
185 aa  153  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  40.72 
 
 
196 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  39.47 
 
 
189 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  41.99 
 
 
173 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  36.84 
 
 
188 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  42.39 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  41.8 
 
 
189 aa  151  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  40.22 
 
 
192 aa  150  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  41.18 
 
 
200 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  36.56 
 
 
187 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  39.67 
 
 
197 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  39.3 
 
 
189 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  40 
 
 
191 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  38.92 
 
 
187 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  41.3 
 
 
193 aa  148  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  39.68 
 
 
188 aa  148  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  39.04 
 
 
187 aa  148  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>