223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0539 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  46.96 
 
 
188 aa  186  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  46.96 
 
 
216 aa  184  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  44.75 
 
 
190 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  43.65 
 
 
193 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  43.09 
 
 
193 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  46.15 
 
 
190 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  47.06 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  45.56 
 
 
187 aa  177  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  44.2 
 
 
186 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  43.41 
 
 
191 aa  174  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  42.86 
 
 
191 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  42.39 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  43.09 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  44.75 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  43.09 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  42.16 
 
 
208 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  44.51 
 
 
189 aa  170  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  42.55 
 
 
188 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  41.53 
 
 
192 aa  168  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 
189 aa  168  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  44.51 
 
 
192 aa  168  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  44.51 
 
 
189 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  41.53 
 
 
221 aa  167  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  42.78 
 
 
191 aa  167  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  42.16 
 
 
193 aa  167  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  40.66 
 
 
186 aa  166  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  41.53 
 
 
192 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  44.51 
 
 
190 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  41.53 
 
 
192 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  42.08 
 
 
192 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  44.44 
 
 
194 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  41.53 
 
 
192 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  41.53 
 
 
192 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  41.53 
 
 
192 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  41.53 
 
 
192 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  41.53 
 
 
192 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  44.44 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  41.53 
 
 
207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  39.06 
 
 
200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  42.08 
 
 
192 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  42.08 
 
 
192 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  42.08 
 
 
192 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  41.53 
 
 
192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  41.53 
 
 
192 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  41.53 
 
 
192 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  41.62 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  41.08 
 
 
198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  43.41 
 
 
190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  41.62 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  42.11 
 
 
190 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  41.76 
 
 
192 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  39.78 
 
 
186 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  39.25 
 
 
189 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  38.74 
 
 
200 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  36.84 
 
 
199 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  37.43 
 
 
195 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  42.31 
 
 
189 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  41.4 
 
 
186 aa  158  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  40.76 
 
 
203 aa  158  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  40.98 
 
 
184 aa  158  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  40.96 
 
 
210 aa  158  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  40.86 
 
 
187 aa  157  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  39.25 
 
 
186 aa  157  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  37.97 
 
 
196 aa  157  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  42.39 
 
 
185 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  42.39 
 
 
185 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  39.57 
 
 
187 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  39.57 
 
 
187 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  39.57 
 
 
187 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  38.92 
 
 
187 aa  156  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  41.76 
 
 
189 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  40.32 
 
 
187 aa  155  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  40.32 
 
 
201 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  42.02 
 
 
214 aa  155  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  39.46 
 
 
197 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  39.57 
 
 
187 aa  154  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  36.27 
 
 
213 aa  154  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  38.12 
 
 
188 aa  154  8e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  45.3 
 
 
219 aa  154  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  41.4 
 
 
186 aa  154  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  39.04 
 
 
188 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  42.86 
 
 
192 aa  153  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  37.1 
 
 
200 aa  153  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  41.21 
 
 
189 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  36.67 
 
 
234 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  37.57 
 
 
188 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  45.98 
 
 
173 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  41.21 
 
 
189 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  40.86 
 
 
201 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  36.32 
 
 
199 aa  151  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  36.32 
 
 
199 aa  151  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  41.05 
 
 
202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  41.53 
 
 
206 aa  150  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  40.32 
 
 
187 aa  151  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  43.01 
 
 
201 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  43.78 
 
 
205 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  39.04 
 
 
187 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0057  putative transcriptional regulator  38.8 
 
 
187 aa  149  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0062  hypothetical protein  38.25 
 
 
187 aa  149  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.492271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>